RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477144.1

HOXB-AS3-209, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 743 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 ERFEQ4G0M1 354 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SYNE4Q8N205 404 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 KCNJ4P48050 445 aa16.57■□□□□ 0.24
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
HOXB-AS3-209ENST00000477144 A0A1B0GUL6 1792 aa16.56■□□□□ 0.24
HOXB-AS3-209ENST00000477144 COL4A1P02462 1669 aa16.56■□□□□ 0.24
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 KIF3CO14782 793 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXB-AS3-209ENST00000477144 VGLL2Q8N8G2 317 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LRRC37AA6NMS7 1700 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HSPA4P34932 840 aa16.54■□□□□ 0.24
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP16.54■□□□□ 0.24
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 C9orf131Q5VYM1 1079 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IL17RAQ96F46 866 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SEC31BQ9NQW1 1179 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HMG20BQ9P0W2 317 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CCDC171Q6TFL3 1326 aa16.53■□□□□ 0.24
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 HSPA6P17066 643 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PSMA5P28066 241 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CAVIN4Q5BKX8 364 aa16.53■□□□□ 0.24
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 CHRNDQ07001 517 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRT32Q14532 448 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXB-AS3-209ENST00000477144 C3orf67Q6ZVT6 689 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TMC4Q7Z404 712 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KIF2CQ99661 725 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXB-AS3-209ENST00000477144 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CEP350Q5VT06 3117 aa16.52■□□□□ 0.24
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 VPS37DQ86XT2 251 aa16.51■□□□□ 0.23
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 IGSF3O75054 1194 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MAP4K1Q92918 833 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NMRK2Q9NPI5 230 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RNF181Q9P0P0 153 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LTBP1Q14766 1721 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SEMA3EO15041 775 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SLC4A3P48751 1232 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NEK4P51957 841 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MAP3K12Q12852 859 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FAM227BQ96M60 508 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TM6SF1Q9BZW5 370 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CTNNA3Q9UI47 895 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MED23Q9ULK4 1368 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 A0A0D9SFI3 127 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TOMM70O94826 608 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GRAPQ13588 217 aa16.48■□□□□ 0.23
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