RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-208ENST00000470089 COA1Q9GZY4 146 aa36.75■■■■□ 3.47
FBXO18-208ENST00000470089 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
FBXO18-208ENST00000470089 KLHDC4Q8TBB5 520 aa36.74■■■■□ 3.47
FBXO18-208ENST00000470089 CLUAP1Q96AJ1 413 aa36.74■■■■□ 3.47
FBXO18-208ENST00000470089 MEIS3Q99687 375 aa36.74■■■■□ 3.47
FBXO18-208ENST00000470089 USP17L3A6NCW0 530 aa36.73■■■■□ 3.47
FBXO18-208ENST00000470089 USP17L4A6NCW7 530 aa36.73■■■■□ 3.47
FBXO18-208ENST00000470089 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
FBXO18-208ENST00000470089 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
FBXO18-208ENST00000470089 USP17L1Q7RTZ2 530 aa36.73■■■■□ 3.47
FBXO18-208ENST00000470089 PASKQ96RG2 1323 aa36.73■■■■□ 3.47
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP36.72■■■■□ 3.47
FBXO18-208ENST00000470089 SAMD7Q7Z3H4 446 aa36.72■■■■□ 3.47
FBXO18-208ENST00000470089 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa36.72■■■■□ 3.47
FBXO18-208ENST00000470089 FBXW7Q969H0 707 aa36.72■■■■□ 3.47
FBXO18-208ENST00000470089 IRS2Q9Y4H2 1338 aa36.71■■■■□ 3.47
FBXO18-208ENST00000470089 LRRC24Q50LG9 513 aa36.71■■■■□ 3.47
FBXO18-208ENST00000470089 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa36.71■■■■□ 3.47
FBXO18-208ENST00000470089 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
FBXO18-208ENST00000470089 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
FBXO18-208ENST00000470089 EGFRP00533 1210 aa36.69■■■■□ 3.46
FBXO18-208ENST00000470089 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
FBXO18-208ENST00000470089 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa36.68■■■■□ 3.46
FBXO18-208ENST00000470089 MXD3Q9BW11 206 aa36.68■■■■□ 3.46
FBXO18-208ENST00000470089 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
FBXO18-208ENST00000470089 AGBL3Q8NEM8 1001 aa36.67■■■■□ 3.46
FBXO18-208ENST00000470089 CD209Q9NNX6 404 aa36.67■■■■□ 3.46
FBXO18-208ENST00000470089 MROH5Q6ZUA9 1318 aa36.66■■■■□ 3.46
FBXO18-208ENST00000470089 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
FBXO18-208ENST00000470089 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP36.66■■■■□ 3.464e-7■■■■□ 25
FBXO18-208ENST00000470089 DACT2Q5SW24 774 aa36.66■■■■□ 3.46
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF609O15014 1411 aa36.66■■■■□ 3.46
FBXO18-208ENST00000470089 METTL24Q5JXM2 366 aa36.65■■■■□ 3.46
FBXO18-208ENST00000470089 GMLQ99445 158 aa36.65■■■■□ 3.46
FBXO18-208ENST00000470089 CREBZFQ9NS37 354 aa36.64■■■■□ 3.46
FBXO18-208ENST00000470089 HDAC5Q9UQL6 1122 aa36.64■■■■□ 3.46
FBXO18-208ENST00000470089 TRAF5O00463 557 aa36.63■■■■□ 3.45
FBXO18-208ENST00000470089 GTF2IP78347 998 aa36.63■■■■□ 3.45
FBXO18-208ENST00000470089 UBE4AQ14139 1066 aa36.63■■■■□ 3.45
FBXO18-208ENST00000470089 STRIP1Q5VSL9 837 aa36.63■■■■□ 3.45
FBXO18-208ENST00000470089 TTLL5Q6EMB2 1281 aa36.63■■■■□ 3.45
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF804AQ7Z570 1209 aa36.63■■■■□ 3.45
FBXO18-208ENST00000470089 PGAP2Q9UHJ9 254 aa36.63■■■■□ 3.45
FBXO18-208ENST00000470089 GNAI3P08754 354 aa36.62■■■■□ 3.45
FBXO18-208ENST00000470089 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa36.62■■■■□ 3.45
FBXO18-208ENST00000470089 TMEM57Q8N5G2 664 aa36.62■■■■□ 3.45
FBXO18-208ENST00000470089 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
FBXO18-208ENST00000470089 KLRG1Q96E93 195 aa36.62■■■■□ 3.45
FBXO18-208ENST00000470089 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
FBXO18-208ENST00000470089 USP17L8P0C7I0 530 aa36.61■■■■□ 3.45
FBXO18-208ENST00000470089 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
FBXO18-208ENST00000470089 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
FBXO18-208ENST00000470089 TRPM7Q96QT4 1865 aa36.6■■■■□ 3.45
FBXO18-208ENST00000470089 TMEM88BA6NKF7 163 aa36.6■■■■□ 3.45
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
FBXO18-208ENST00000470089 SIL1Q9H173 461 aa36.59■■■■□ 3.45
FBXO18-208ENST00000470089 EYA2O00167 538 aa36.58■■■■□ 3.45
FBXO18-208ENST00000470089 GYG1P46976 350 aa36.58■■■■□ 3.45
FBXO18-208ENST00000470089 VGLL2Q8N8G2 317 aa36.58■■■■□ 3.45
FBXO18-208ENST00000470089 IL1R1P14778 569 aa36.57■■■■□ 3.44
FBXO18-208ENST00000470089 MYO3BQ8WXR4 1341 aa36.57■■■■□ 3.44
FBXO18-208ENST00000470089 PDE8BO95263 885 aa36.56■■■■□ 3.44
FBXO18-208ENST00000470089 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP36.56■■■■□ 3.44
FBXO18-208ENST00000470089 MYOZ2Q9NPC6 264 aa36.56■■■■□ 3.44
FBXO18-208ENST00000470089 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
FBXO18-208ENST00000470089 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
FBXO18-208ENST00000470089 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
FBXO18-208ENST00000470089 JAG2Q9Y219 1238 aa36.55■■■■□ 3.44
FBXO18-208ENST00000470089 ATG9AQ7Z3C6 839 aa36.54■■■■□ 3.44
FBXO18-208ENST00000470089 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
FBXO18-208ENST00000470089 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
FBXO18-208ENST00000470089 RLBP1P12271 317 aa36.53■■■■□ 3.44
FBXO18-208ENST00000470089 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
FBXO18-208ENST00000470089 CDC37L1Q7L3B6 337 aa36.53■■■■□ 3.44
FBXO18-208ENST00000470089 USP48Q86UV5 1035 aa36.53■■■■□ 3.44
FBXO18-208ENST00000470089 KIAA0825Q8IV33 1275 aa36.53■■■■□ 3.44
FBXO18-208ENST00000470089 DLK2Q6UY11 383 aa36.52■■■■□ 3.44
FBXO18-208ENST00000470089 GGA3Q9NZ52 723 aa36.52■■■■□ 3.44
FBXO18-208ENST00000470089 GNAI2P04899 355 aa36.51■■■■□ 3.44
FBXO18-208ENST00000470089 SCARF1Q14162 830 aa36.51■■■■□ 3.44
FBXO18-208ENST00000470089 OGFOD1Q8N543 542 aa36.51■■■■□ 3.44
FBXO18-208ENST00000470089 CERS5Q8N5B7 392 aa36.51■■■■□ 3.44
FBXO18-208ENST00000470089 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.44
FBXO18-208ENST00000470089 CST9Q5W186 159 aa36.5■■■■□ 3.43
FBXO18-208ENST00000470089 SRGAP3O43295 1099 aa36.49■■■■□ 3.43
FBXO18-208ENST00000470089 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
FBXO18-208ENST00000470089 KRT26Q7Z3Y9 468 aa36.49■■■■□ 3.43
FBXO18-208ENST00000470089 ITPRIPQ8IWB1 547 aa36.49■■■■□ 3.43
FBXO18-208ENST00000470089 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
FBXO18-208ENST00000470089 CIAO1O76071 339 aa36.48■■■■□ 3.43
FBXO18-208ENST00000470089 VPS37DQ86XT2 251 aa36.48■■■■□ 3.43
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF408Q9H9D4 720 aa36.48■■■■□ 3.43
FBXO18-208ENST00000470089 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
FBXO18-208ENST00000470089 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
FBXO18-208ENST00000470089 ADM5C9JUS6 153 aa36.47■■■■□ 3.43
FBXO18-208ENST00000470089 SASH1O94885 1247 aa36.47■■■■□ 3.43
FBXO18-208ENST00000470089 CELF2O95319 508 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
FBXO18-208ENST00000470089 FGFR2P21802 821 aa36.47■■■■□ 3.43
FBXO18-208ENST00000470089 MTX1Q13505 466 aa36.47■■■■□ 3.43
FBXO18-208ENST00000470089 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms