RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 CAPN2P17655 700 aa15.77■□□□□ 0.11
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SH3BP1-206ENST00000469947 ABTB2Q8N961 1025 aa15.77■□□□□ 0.11
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SH3BP1-206ENST00000469947 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.11
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SH3BP1-206ENST00000469947 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa15.74■□□□□ 0.11
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SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
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SH3BP1-206ENST00000469947 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-206ENST00000469947 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-206ENST00000469947 SMARCE1Q969G3 411 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-206ENST00000469947 TRIM34Q9BYJ4 488 aa15.69■□□□□ 0.1
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SH3BP1-206ENST00000469947 ATP5JP18859 108 aa15.68■□□□□ 0.1
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