RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469303.1

SRSF10-208, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 10, human

TSL 3

Gene SRSF10, Length 413 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRSF10-208	ENST00000469303	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SRSF10-208	ENST00000469303	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SRSF10-208	ENST00000469303	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SRSF10-208	ENST00000469303	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SRSF10-208	ENST00000469303	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SRSF10-208	ENST00000469303	TNFRSF25	Q93038	417 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SRSF10-208	ENST00000469303	NXPE3	Q969Y0	559 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SRSF10-208	ENST00000469303	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SRSF10-208	ENST00000469303	C12orf49	Q9H741	205 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SRSF10-208	ENST00000469303	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SRSF10-208	ENST00000469303	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SRSF10-208	ENST00000469303	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SRSF10-208	ENST00000469303	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SRSF10-208	ENST00000469303	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SRSF10-208	ENST00000469303	EPX	P11678	715 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SRSF10-208	ENST00000469303	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SRSF10-208	ENST00000469303	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SRSF10-208	ENST00000469303	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SRSF10-208	ENST00000469303	MAP3K10	Q02779	954 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SRSF10-208	ENST00000469303	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SRSF10-208	ENST00000469303	CCNJL	Q8IV13	435 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SRSF10-208	ENST00000469303	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SRSF10-208	ENST00000469303	ELOA3	Q8NG57	546 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SRSF10-208	ENST00000469303	PBX4	Q9BYU1	374 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SRSF10-208	ENST00000469303	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SRSF10-208	ENST00000469303	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	GHRH	P01286	108 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	NEFL	P07196	543 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	EDN3	P14138	238 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	BAG6	P46379	1132 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	MAP2K3	P46734	347 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	TREML4	Q6UXN2	200 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	FBF1	Q8TES7	1133 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	MRS2	Q9HD23	443 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	COPRS	Q9NQ92	184 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303		A0A096LPE4	126 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303		A0A1W2PPZ6	126 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303		M0R082	166 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	PAGE1	O75459	146 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	EPHA1	P21709	976 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	NEUROD1	Q13562	356 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	MAP3K11	Q16584	847 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	RASIP1	Q5U651	963 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	CHSY3	Q70JA7	882 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	STK35	Q8TDR2	534 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	PMEPA1	Q969W9	287 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	BTBD6	Q96KE9	485 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	SPG7	Q9UQ90	795 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	OIP5	O43482	229 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	ECEL1	O95672	775 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	CELA3A	P09093	270 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	SLURP2	P0DP57	97 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	FANCC	Q00597	558 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	ZNF394	Q53GI3	561 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	SPACA7	Q96KW9	195 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	LINC01387	J3KSC0	135 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	BCR	P11274	1271 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	ZNF576	Q9H609	170 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	FAM229A	H3BQW9	127 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	TCF3	P15923	654 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	AMPD1	P23109	780 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	VAMP1	P23763	118 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	TNNI2	P48788	182 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SRSF10-208	ENST00000469303	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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