RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 MRE11P49959 708 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 ARHGEF6Q15052 776 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 PSMD1Q99460 953 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 SLFN5Q08AF3 891 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 C8orf34Q49A92 452 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 USP48Q86UV5 1035 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 ISCA1Q9BUE6 129 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 PANK2Q9BZ23 570 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 COA1Q9GZY4 146 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 ATP2B3Q16720 1220 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 SLC10A5Q5PT55 438 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM88BA6NKF7 163 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 RPS12P25398 132 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 CXCL9Q07325 125 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 VPS33BQ9H267 617 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 CSADQ9Y600 493 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 MAST3O60307 1309 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 SEC24BO95487 1268 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 GPSM2P81274 684 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 CHRNDQ07001 517 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 KIAA2012Q0VF49 1180 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 MFSD14BQ5SR56 506 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 SLC10A4Q96EP9 437 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 MYO3BQ8WXR4 1341 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 BTAF1O14981 1849 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 MVPQ14764 893 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 ERC1Q8IUD2 1116 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 UBN2Q6ZU65 1347 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 TTLL11Q8NHH1 800 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 TBC1D16Q8TBP0 767 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 TBC1D2Q9BYX2 928 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 TAOK2Q9UL54 1235 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 NFKBIEO00221 500 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 EPS15P42566 896 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 DDX19BQ9UMR2 479 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 PSMD14O00487 310 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 LDHBP07195 334 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 IL15P40933 162 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 GRPEL1Q9HAV7 217 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 COL18A1P39060 1754 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 DOT1LQ8TEK3 1739 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 ESPNB1AK53 854 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 BAG3O95817 575 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 APPP05067 770 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 MCTP1Q6DN14 999 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 SAMD7Q7Z3H4 446 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 WDR66Q8TBY9 1149 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 MROH5Q6ZUA9 1318 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 SCNN1DP51172 638 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 GSTO1P78417 241 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 KIF22Q14807 665 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 TEKT1Q969V4 418 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 TOMM22Q9NS69 142 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 CLRN2A0PK11 232 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 IDH1O75874 414 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF853P0CG23 659 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 NASPP49321 788 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 PDE3AQ14432 1141 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 GGA3Q9NZ52 723 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 MINPP1Q9UNW1 487 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 IREB2P48200 963 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 UBE4AQ14139 1066 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 NHSQ6T4R5 1651 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 DCAF15Q66K64 600 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 TNS4Q8IZW8 715 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 RNF214Q8ND24 703 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 EYA2O00167 538 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 USP5P45974 858 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-205ENST00000468371 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms