RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468031.1

NME4-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2

Gene NME4, Length 1,861 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-210ENST00000468031 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.34■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 MBD3O95983 291 aa22.34■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 FGFR2P21802 821 aa22.34■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.34■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 FBXO41Q8TF61 875 aa22.34■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 LPIN2Q92539 896 aa22.34■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 OSBP2Q969R2 916 aa22.34■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 M0R2C6 588 aa22.33■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 MCAMP43121 646 aa22.33■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.33■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 APPBP2Q92624 585 aa22.33■■□□□ 1.17
NME4-210ENST00000468031 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.32■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.32■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.167e-7■■■□□ 17.5
NME4-210ENST00000468031 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.32■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.32■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 GPT2Q8TD30 523 aa22.32■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 LAMA4Q16363 1823 aa22.31■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 ATRNO75882 1429 aa22.31■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 F13A1P00488 732 aa22.31■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 HSPA1LP34931 641 aa22.31■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 NECAB1Q8N987 351 aa22.31■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.31■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.31■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.31■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.31■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 NHSQ6T4R5 1651 aa22.31■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 ZNF445P59923 1031 aa22.3■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.3■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.3■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.3■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 SCN7AQ01118 1682 aa22.3■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 PDCP20941 246 aa22.3■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 CCDC102BQ68D86 513 aa22.3■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.3■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 USP21Q9UK80 565 aa22.3■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 MTMR6Q9Y217 621 aa22.3■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 SLC5A1P13866 664 aa22.29■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 WASHC4Q2M389 1173 aa22.29■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 Q6ZUG5 572 aa22.29■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 PI16Q6UXB8 463 aa22.28■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.28■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.28■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 BTAF1O14981 1849 aa22.28■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 FAM177BA6PVY3 158 aa22.28■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 E7EWF7 191 aa22.28■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 GTF3C6Q969F1 213 aa22.28■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 ADD2P35612 726 aa22.27■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 UBE3CQ15386 1083 aa22.27■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.27■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.27■■□□□ 1.16
NME4-210ENST00000468031 PHKA1P46020 1223 aa22.26■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 FOXP2O15409 715 aa22.26■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 FBXL16Q8N461 479 aa22.26■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 TCHHQ07283 1943 aa22.24■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 GPAA1O43292 621 aa22.24■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 DOCK2Q92608 1830 aa22.24■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 USP48Q86UV5 1035 aa22.24■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 BRF1Q92994 677 aa22.24■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 PFKFB2O60825 505 aa22.23■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 RPS6KA4O75676 772 aa22.23■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 FGD1P98174 961 aa22.23■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.23■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.23■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 FGAP02671 866 aa22.22■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 SPATA5Q8NB90 893 aa22.22■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.22■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 NARFQ9UHQ1 456 aa22.22■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.22■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.22■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.22■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 STK3Q13188 491 aa22.21■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.21■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.21■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 LY75O60449 1722 aa22.21■■□□□ 1.15
NME4-210ENST00000468031 A0A0G2JLW4 131 aa22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.2 ms