RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 COL4A5P29400 1685 aa10.91□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 SBF1O95248 1867 aa10.91□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa10.9□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 RAB11FIP3O75154 756 aa10.9□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 IGHDP01880 384 aa10.9□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 SLC5A1P13866 664 aa10.9□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 GYG1P46976 350 aa10.9□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 TIMM10P62072 90 aa10.9□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 RHPN1Q8TCX5 695 aa10.9□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 LPIN2Q92539 896 aa10.9□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 NEUROD6Q96NK8 337 aa10.9□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 DCTPP1Q9H773 170 aa10.9□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa10.9□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 AKAP2Q9Y2D5 859 aa10.9□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 IRS2Q9Y4H2 1338 aa10.89□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 A0A1B0GUL7 405 aa10.89□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 ECE2O60344 883 aa10.89□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 ADORA1P30542 326 aa10.89□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 TNNI3KQ59H18 835 aa10.89□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF804AQ7Z570 1209 aa10.89□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 VPS37DQ86XT2 251 aa10.89□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 KIF1BPQ96EK5 621 aa10.89□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa10.89□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF609O15014 1411 aa10.89□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 YDJCA8MPS7 323 aa10.88□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 BCAMP50895 628 aa10.88□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 CAVIN4Q5BKX8 364 aa10.88□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 TIAM2Q8IVF5 1701 aa10.88□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 XAGE2Q96GT9 111 aa10.88□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 LRRCC1Q9C099 1032 aa10.88□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 COA1Q9GZY4 146 aa10.88□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 GPR108Q9NPR9 543 aa10.88□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 KCNQ5Q9NR82 932 aa10.88□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 ZNRF3Q9ULT6 936 aa10.88□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF541Q9H0D2 1346 aa10.87□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 FZD9O00144 591 aa10.87□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 RAD17O75943 681 aa10.87□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 GORABQ5T7V8 394 aa10.87□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa10.87□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 FBXO33Q7Z6M2 555 aa10.87□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 AACSQ86V21 672 aa10.87□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 FBXW7Q969H0 707 aa10.87□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 GCC1Q96CN9 775 aa10.87□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 CD209Q9NNX6 404 aa10.87□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 PHKA1P46020 1223 aa10.86□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 EIF6P56537 245 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 CXCL9Q07325 125 aa10.86□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 ANKRD45Q5TZF3 282 aa10.86□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 PODNQ7Z5L7 613 aa10.86□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 DBNDD2Q9BQY9 259 aa10.86□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 JAG2Q9Y219 1238 aa10.86□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 GJA3Q9Y6H8 435 aa10.86□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 ARAP2Q8WZ64 1704 aa10.86□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 CHD4Q14839 1912 aa10.86□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 PSMD14O00487 310 aa10.85□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 IL1R1P14778 569 aa10.85□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC102BQ68D86 513 aa10.85□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 CIAPIN1Q6FI81 312 aa10.85□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 SMC5Q8IY18 1101 aa10.85□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 USP17L3A6NCW0 530 aa10.84□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 USP17L4A6NCW7 530 aa10.84□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 DDNO94850 711 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 GTF2IP78347 998 aa10.84□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 TTC39AQ5SRH9 613 aa10.84□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 TTLL5Q6EMB2 1281 aa10.84□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 DPY19L2Q6NUT2 758 aa10.84□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 USP17L1Q7RTZ2 530 aa10.84□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC136Q96JN2 1154 aa10.84□□□□□ -0.67
CASQ1-202ENST00000467691 GLTPD2A6NH11 291 aa10.83□□□□□ -0.68
CASQ1-202ENST00000467691 YY1P25490 414 aa10.83□□□□□ -0.68
CASQ1-202ENST00000467691 TNIP1Q15025 636 aa10.83□□□□□ -0.68
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC158Q5M9N0 1113 aa10.83□□□□□ -0.68
CASQ1-202ENST00000467691 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
CASQ1-202ENST00000467691 GPC2Q8N158 579 aa10.83□□□□□ -0.68
CASQ1-202ENST00000467691 MXD3Q9BW11 206 aa10.83□□□□□ -0.68
CASQ1-202ENST00000467691 LNPKQ9C0E8 428 aa10.83□□□□□ -0.68
CASQ1-202ENST00000467691 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
CASQ1-202ENST00000467691 SCN9AQ15858 1988 aa10.83□□□□□ -0.68
CASQ1-202ENST00000467691 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms