RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.55■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 STRN4Q9NRL3 753 aa21.55■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 FOSBP53539 338 aa21.55■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 TCIRG1Q13488 830 aa21.55■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 SPC24Q8NBT2 197 aa21.55■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.55■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.54■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 M0R2C6 588 aa21.54■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 EVA1CP58658 441 aa21.54■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 WASHC4Q2M389 1173 aa21.54■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 FBXO3Q9UK99 471 aa21.54■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 TNS2Q63HR2 1409 aa21.53■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 A0A0G2JLW4 131 aa21.53■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 CTDNEP1O95476 244 aa21.53■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.53■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.53■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 CHST3Q7LGC8 479 aa21.52■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 OSBP2Q969R2 916 aa21.52■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 XAGE2Q96GT9 111 aa21.52■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 CBX8Q9HC52 389 aa21.52■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 SPEF2Q9C093 1822 aa21.52■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 DYNC1I1O14576 645 aa21.52■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa21.52■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 PAPPAQ13219 1627 aa21.52■■□□□ 1.04
SYNE4-204ENST00000465425 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 FAM89AQ96GI7 184 aa21.51■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 PDCL3Q9H2J4 239 aa21.51■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 FAM13BQ9NYF5 915 aa21.51■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 LAMA4Q16363 1823 aa21.51■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 RBM10P98175 930 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.51■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 ADORA1P30542 326 aa21.5■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 HSPA2P54652 639 aa21.5■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF165P49910 485 aa21.5■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 ATL3Q6DD88 541 aa21.5■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 SPTLC3Q9NUV7 552 aa21.5■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.49■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 PPFIA3O75145 1194 aa21.49■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 CAVIN2O95810 425 aa21.49■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 ADD1P35611 737 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.49■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 DNAJC25Q9H1X3 360 aa21.49■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 RCOR1Q9UKL0 485 aa21.49■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 DRC7Q8IY82 874 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 PRIMPOLQ96LW4 560 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 TRIM5Q9C035 493 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 STARD3NLO95772 234 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 HAND2P61296 217 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 GUCY1B3Q02153 619 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 KCNF1Q9H3M0 494 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 CTAGE5O15320 804 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 ZAP70P43403 619 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 DNAJC10Q8IXB1 793 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 FBXL16Q8N461 479 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 KIAA1524Q8TCG1 905 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 USP28Q96RU2 1077 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 PLA2G12BQ9BX93 195 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 SLAIN2Q9P270 581 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 APPBP2Q92624 585 aa21.46■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.46■■□□□ 1.03
SYNE4-204ENST00000465425 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 FGAP02671 866 aa21.45■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 CSF1RP07333 972 aa21.45■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 ME1P48163 572 aa21.45■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 SCARF1Q14162 830 aa21.45■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 METTL24Q5JXM2 366 aa21.45■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 MYRIPQ8NFW9 859 aa21.45■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 MAP7D2Q96T17 732 aa21.45■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.45■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 KINO60870 393 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 ATP2B3Q16720 1220 aa21.45■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 PYCARDQ9ULZ3 195 aa21.45■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 ABCC12Q96J65 1359 aa21.44■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa21.44■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 EVCP57679 992 aa21.44■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.44■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 PRC1O43663 620 aa21.44■■□□□ 1.02
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