RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 ADAMTS2O95450 1211 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 EPXP11678 715 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 CPB1P15086 417 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 HFE2Q6ZVN8 426 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 PLD4Q96BZ4 506 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 TCF12Q99081 682 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 TCF3P15923 654 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 KANK3Q6NY19 840 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM87AQ8NBN3 555 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 NXPE3Q969Y0 559 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 PPM1HQ9ULR3 514 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 NFKBIEO00221 500 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 WFS1O76024 890 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 USP17L7P0C7H9 530 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 SLURP2P0DP57 97 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 KRT76Q01546 638 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 GLIS3Q8NEA6 775 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 ANKRD24Q8TF21 1146 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 RASSF4Q9H2L5 321 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM177BA6PVY3 158 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 ST13P50502 369 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 PERM1Q5SV97 790 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 CEP135Q66GS9 1140 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 ACDQ96AP0 544 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 ABCB6Q9NP58 842 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 IGSF5Q9NSI5 407 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 USP31Q70CQ4 1352 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 CTSHP09668 335 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 ACPPP15309 386 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 PTPRAP18433 802 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 ITPKAP23677 461 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 FCGRTP55899 365 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 ATP11AP98196 1134 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 DTHD1Q6ZMT9 781 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 EDARADDQ8WWZ3 215 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 LPIN3Q9BQK8 851 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 NAGPAQ9UK23 515 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 A0A096LPE4 126 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 A0A1W2PPZ6 126 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 OIP5O43482 229 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 BCRP11274 1271 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 BSNDQ8WZ55 320 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 GALNT6Q8NCL4 622 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 C3orf58Q8NDZ4 430 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 ASAP3Q8TDY4 903 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 ADAM19Q9H013 955 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 TRPA1O75762 1119 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF76P36508 570 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 GMPRP36959 345 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 GRIA4P48058 902 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 LDLRAD1Q5T700 205 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 RNF34Q969K3 372 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 CEP44Q9C0F1 390 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 CABP4P57796 275 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 TREML4Q6UXN2 200 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 MUC3BQ9H195 1237 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 AKAP2Q9Y2D5 859 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 STARD13Q9Y3M8 1113 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 LILRB5O75023 590 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 CDC27P30260 824 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 MAP3K10Q02779 954 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 SPRED3Q2MJR0 410 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 C20orf204Q6ZNR8 217 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 BTBD6Q96KE9 485 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 HHIPQ96QV1 700 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 PRDM6Q9NQX0 595 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 ENAMQ9NRM1 1142 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 RLBP1P12271 317 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 FANCCQ00597 558 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 CHSY3Q70JA7 882 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 SV2BQ7L1I2 683 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 NUDT8Q8WV74 236 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF576Q9H609 170 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 SOX13Q9UN79 622 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 TRIM33Q9UPN9 1127 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 METTL12A8MUP2 240 aa9.06□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 ALBP02768 609 aa9.06□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 AMPD1P23109 780 aa9.06□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 MEI1Q5TIA1 1274 aa9.06□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 HS2ST1Q7LGA3 356 aa9.06□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 M0R082 166 aa9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms