RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445077.1

RBMS3-208, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 3, human

TSL 3

Gene RBMS3, Length 448 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS3-208	ENST00000445077	MET	P08581	1390 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	SLIT1	O75093	1534 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	STX10	O60499	249 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	SMC2	O95347	1197 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	CMA1	P23946	247 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	HOXC9	P31274	260 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	CCZ1B	P86790	482 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	LRMP	Q12912	555 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077		Q6ZUG5	572 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	MPND	Q8N594	471 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	10.13	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	IP6K1	Q92551	441 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	WASF1	Q92558	559 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	COPRS	Q9NQ92	184 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	10.13	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	RICTOR	Q6R327	1708 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	MED23	Q9ULK4	1368 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	TULP2	O00295	520 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	PPP6R2	O75170	966 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	LARGE1	O95461	756 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	SERPINC1	P01008	464 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	EVC	P57679	992 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	TSC1	Q92574	1164 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	TNR	Q92752	1358 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	CCDC151	A5D8V7	595 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	SPTLC2	O15270	562 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	UBASH3A	P57075	661 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	MYL5	Q02045	173 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	TRIM29	Q14134	588 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	ELF2	Q15723	593 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	TMC6	Q7Z403	805 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	GOLGA1	Q92805	767 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	CCDC51	Q96ER9	411 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	HAUS7	Q99871	368 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	CPLX1	O14810	134 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	FOXO3	O43524	673 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	PIP4K2B	P78356	416 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	EVX2	Q03828	476 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	MAP9	Q49MG5	647 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	HDX	Q7Z353	690 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	MLKL	Q8NB16	471 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	SMARCE1	Q969G3	411 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	C8orf76	Q96K31	380 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	ATG3	Q9NT62	314 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	LRRC37A3	O60309	1634 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	TSPOAP1	O95153	1857 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RBMS3-208	ENST00000445077	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	10.09	□□□□□ -0.79

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