RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 POTEEQ6S8J3 1075 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 GAS2L3Q86XJ1 694 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 AMOTL1Q8IY63 956 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 SPZ1Q9BXG8 430 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 SCOCQ9UIL1 159 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 ADAM21Q9UKJ8 722 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 P4HA2O15460 535 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 PTGS1P23219 599 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 NUP62CLQ9H1M0 184 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CORO7P57737 925 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CFAP100Q494V2 611 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 ARHGAP18Q8N392 663 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CNNM3Q8NE01 707 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 ALS2CR12Q96Q35 445 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 SPATA7Q9P0W8 599 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 STIM2Q9P246 746 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 MCM8Q9UJA3 840 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 KRT75O95678 551 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 NAT1P18440 290 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CPLX4Q7Z7G2 160 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 TBC1D32Q96NH3 1257 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 PACS2Q86VP3 889 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 ATP6V1E2Q96A05 226 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CTAGE1Q96RT6 745 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 HDAC9Q9UKV0 1011 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 USP5P45974 858 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 GNG11P61952 73 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 SCRN1Q12765 414 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 TUBA3CQ13748 450 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CFAP157Q5JU67 520 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 C6orf163Q5TEZ5 329 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 FAM71BQ8TC56 605 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CCHCR1Q8TD31 782 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 IFT81Q8WYA0 676 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 KIF7Q2M1P5 1343 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 TSPY2A6NKD2 308 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 TSPY3P0CV98 308 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 TSPY8P0CW00 308 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 TSPY1Q01534 308 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 PPP1R7Q15435 360 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 BBOF1Q8ND07 529 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 C3orf20Q8ND61 904 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD7Q92527 254 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CLUAP1Q96AJ1 413 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 NUF2Q9BZD4 464 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 FAM169AQ9Y6X4 670 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CBFA2T2O43439 604 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 KRT14P02533 472 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 KRT4P19013 534 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 ECE1P42892 770 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 RAB3GAP1Q15042 981 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 SLFNL1Q499Z3 407 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 SMC1BQ8NDV3 1235 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM35Q9UPQ4 493 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 COQ9O75208 318 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 KRT7P08729 469 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 ADCY1Q08828 1119 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 WTAPQ15007 396 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 IQCB1Q15051 598 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 TAF11Q15544 211 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 FGD4Q96M96 766 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 FLOT1O75955 427 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 MUM1Q2TAK8 710 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 DUSP27Q5VZP5 1158 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 RASAL2Q9UJF2 1139 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF148Q9UQR1 794 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 GNAT2P19087 354 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 PHBP35232 272 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 NFE2L2Q16236 605 aa6.31□□□□□ -1.4
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