RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 ATP2B3Q16720 1220 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 METTL24Q5JXM2 366 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 GORABQ5T7V8 394 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 FSD2A1L4K1 749 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 RPS6KB1P23443 525 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 SMIM5Q71RC9 77 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 SYNE4Q8N205 404 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 MYH7P12883 1935 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 SCN7AQ01118 1682 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 SUSD4Q5VX71 490 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 MCTP1Q6DN14 999 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 PDE8BO95263 885 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 ADORA1P30542 326 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 CPA1P15085 419 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 NTSR2O95665 410 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 NEK1Q96PY6 1258 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 MAST3O60307 1309 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.2■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.2■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 ZBTB7AO95365 584 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 FGFR2P21802 821 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 LPIN2Q92539 896 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 CYP21A2P08686 494 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.147e-9■■■□□ 15.3
SH3BP2-202ENST00000435136 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 LARGE1O95461 756 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 ME3Q16798 604 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 APPBP2Q92624 585 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 LAMA4Q16363 1823 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 STX6O43752 255 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 MBD3O95983 291 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 ZAP70P43403 619 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC5A1P13866 664 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 MRE11P49959 708 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 CHGBP05060 677 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 SYT1P21579 422 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 MCAMP43121 646 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 ST3GAL1Q11201 340 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 SCARF1Q14162 830 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 DOCK2Q92608 1830 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 PHF14O94880 888 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 OSBP2Q969R2 916 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 M0R2C6 588 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-202ENST00000435136 PDCP20941 246 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-202ENST00000435136 GJB2P29033 226 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-202ENST00000435136 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-202ENST00000435136 C4BP0C0L5 1744 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-202ENST00000435136 GNPATO15228 680 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-202ENST00000435136 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-202ENST00000435136 UBE3CQ15386 1083 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC102BQ68D86 513 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-202ENST00000435136 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-202ENST00000435136 FBXL16Q8N461 479 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-202ENST00000435136 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-202ENST00000435136 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.12■■□□□ 1.13
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