RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 LPIN2Q92539 896 aa29.53■■■□□ 2.32
CTU1-201ENST00000421832 TPM2P07951 284 aa29.52■■■□□ 2.32
CTU1-201ENST00000421832 PDE6BP35913 854 aa29.52■■■□□ 2.32
CTU1-201ENST00000421832 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
CTU1-201ENST00000421832 GORABQ5T7V8 394 aa29.51■■■□□ 2.31
CTU1-201ENST00000421832 CACNA1SQ13698 1873 aa29.51■■■□□ 2.31
CTU1-201ENST00000421832 CRAMP1Q96RY5 1269 aa29.51■■■□□ 2.31
CTU1-201ENST00000421832 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
CTU1-201ENST00000421832 ESPNB1AK53 854 aa29.49■■■□□ 2.31
CTU1-201ENST00000421832 TRAK2O60296 914 aa29.49■■■□□ 2.31
CTU1-201ENST00000421832 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
CTU1-201ENST00000421832 SLC5A1P13866 664 aa29.49■■■□□ 2.31
CTU1-201ENST00000421832 PANK2Q9BZ23 570 aa29.49■■■□□ 2.31
CTU1-201ENST00000421832 DDX11L8A8MPP1 907 aa29.48■■■□□ 2.31
CTU1-201ENST00000421832 PHKA1P46020 1223 aa29.48■■■□□ 2.31
CTU1-201ENST00000421832 SCARF1Q14162 830 aa29.48■■■□□ 2.31
CTU1-201ENST00000421832 CNTROBQ8N137 903 aa29.48■■■□□ 2.31
CTU1-201ENST00000421832 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
CTU1-201ENST00000421832 AKAP11Q9UKA4 1901 aa29.48■■■□□ 2.31
CTU1-201ENST00000421832 NPR1P16066 1061 aa29.48■■■□□ 2.31
CTU1-201ENST00000421832 CCDC158Q5M9N0 1113 aa29.48■■■□□ 2.31
CTU1-201ENST00000421832 TTC39AQ5SRH9 613 aa29.48■■■□□ 2.31
CTU1-201ENST00000421832 HAUS7Q99871 368 aa29.48■■■□□ 2.31
CTU1-201ENST00000421832 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
CTU1-201ENST00000421832 C2CD5Q86YS7 1000 aa29.47■■■□□ 2.31
CTU1-201ENST00000421832 CHRNA5P30532 468 aa29.46■■■□□ 2.31
CTU1-201ENST00000421832 CCDC102BQ68D86 513 aa29.46■■■□□ 2.31
CTU1-201ENST00000421832 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
CTU1-201ENST00000421832 C10orf71Q711Q0 1435 aa29.46■■■□□ 2.31
CTU1-201ENST00000421832 GRPEL1Q9HAV7 217 aa29.46■■■□□ 2.31
CTU1-201ENST00000421832 BBOX1O75936 387 aa29.45■■■□□ 2.31
CTU1-201ENST00000421832 KLRK1P26718 216 aa29.45■■■□□ 2.31
CTU1-201ENST00000421832 UBE4AQ14139 1066 aa29.45■■■□□ 2.31
CTU1-201ENST00000421832 PI16Q6UXB8 463 aa29.45■■■□□ 2.31
CTU1-201ENST00000421832 ANKRD2Q9GZV1 360 aa29.45■■■□□ 2.31
CTU1-201ENST00000421832 LRRC37AA6NMS7 1700 aa29.45■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 CHMLP26374 656 aa29.44■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 EVI5LQ96CN4 794 aa29.44■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 MASTLQ96GX5 879 aa29.44■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 MTFR1LQ9H019 292 aa29.44■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 SNRKQ9NRH2 765 aa29.44■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 BCAMP50895 628 aa29.44■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP29.43■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 MCAMP43121 646 aa29.43■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa29.43■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 H0YIN7 160 aa29.42■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 GPSM2P81274 684 aa29.42■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 OLFM4Q6UX06 510 aa29.42■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP29.42■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 GYG1P46976 350 aa29.41■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 SLX4Q8IY92 1834 aa29.41■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 ZNF804BA4D1E1 1349 aa29.41■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 GOLIM4O00461 696 aa29.41■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 KCNJ4P48050 445 aa29.41■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 IL25Q9H293 177 aa29.4■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 PAG1Q9NWQ8 432 aa29.4■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 KIF13BQ9NQT8 1826 aa29.4■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 LTBP1Q14766 1721 aa29.4■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 XDHP47989 1333 aa29.4■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 ALDH1B1P30837 517 aa29.4■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP29.4■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 PDCL3Q9H2J4 239 aa29.4■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 ZAP70P43403 619 aa29.39■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 TXNRD3Q86VQ6 643 aa29.39■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 FSD1Q9BTV5 496 aa29.39■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
CTU1-201ENST00000421832 CHGBP05060 677 aa29.38■■■□□ 2.29
CTU1-201ENST00000421832 PTMSP20962 102 aa29.38■■■□□ 2.29
CTU1-201ENST00000421832 IRS2Q9Y4H2 1338 aa29.38■■■□□ 2.29
CTU1-201ENST00000421832 DLEC1Q9Y238 1755 aa29.38■■■□□ 2.29
CTU1-201ENST00000421832 STYK1Q6J9G0 422 aa29.38■■■□□ 2.29
CTU1-201ENST00000421832 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
CTU1-201ENST00000421832 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa29.38■■■□□ 2.29
CTU1-201ENST00000421832 CASC1Q6TDU7 716 aa29.37■■■□□ 2.29
CTU1-201ENST00000421832 SP8Q8IXZ3 490 aa29.37■■■□□ 2.29
CTU1-201ENST00000421832 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
CTU1-201ENST00000421832 RASGRF1Q13972 1273 aa29.36■■■□□ 2.29
CTU1-201ENST00000421832 SGIP1Q9BQI5 828 aa29.36■■■□□ 2.29
CTU1-201ENST00000421832 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa29.36■■■□□ 2.29
CTU1-201ENST00000421832 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
CTU1-201ENST00000421832 HMG20BQ9P0W2 317 aa29.36■■■□□ 2.29
CTU1-201ENST00000421832 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa29.35■■■□□ 2.29
CTU1-201ENST00000421832 LEMD3Q9Y2U8 911 aa29.35■■■□□ 2.29
CTU1-201ENST00000421832 POLD1P28340 1107 aa29.35■■■□□ 2.29
CTU1-201ENST00000421832 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
CTU1-201ENST00000421832 TMC4Q7Z404 712 aa29.35■■■□□ 2.29
CTU1-201ENST00000421832 KBTBD3Q8NAB2 608 aa29.35■■■□□ 2.29
CTU1-201ENST00000421832 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
CTU1-201ENST00000421832 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa29.33■■■□□ 2.29
CTU1-201ENST00000421832 UFL1O94874 794 aa29.33■■■□□ 2.29
CTU1-201ENST00000421832 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
CTU1-201ENST00000421832 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
CTU1-201ENST00000421832 PODXL2Q9NZ53 605 aa29.33■■■□□ 2.29
CTU1-201ENST00000421832 POLLQ9UGP5 575 aa29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.1 ms