RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
GPC1-202ENST00000420138 STK32BQ9NY57 414 aa25.28■■□□□ 1.64
GPC1-202ENST00000420138 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.27■■□□□ 1.64
GPC1-202ENST00000420138 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.27■■□□□ 1.64
GPC1-202ENST00000420138 RASEFQ8IZ41 740 aa25.27■■□□□ 1.64
GPC1-202ENST00000420138 CNBD1Q8NA66 436 aa25.27■■□□□ 1.64
GPC1-202ENST00000420138 KCNB2Q92953 911 aa25.27■■□□□ 1.64
GPC1-202ENST00000420138 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
GPC1-202ENST00000420138 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
GPC1-202ENST00000420138 SLC5A1P13866 664 aa25.26■■□□□ 1.63
GPC1-202ENST00000420138 MINPP1Q9UNW1 487 aa25.26■■□□□ 1.63
GPC1-202ENST00000420138 SNX14Q9Y5W7 946 aa25.26■■□□□ 1.63
GPC1-202ENST00000420138 NECTIN1Q15223 517 aa25.26■■□□□ 1.63
GPC1-202ENST00000420138 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
GPC1-202ENST00000420138 DDR1Q08345 913 aa25.25■■□□□ 1.63
GPC1-202ENST00000420138 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa25.24■■□□□ 1.63
GPC1-202ENST00000420138 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa25.24■■□□□ 1.63
GPC1-202ENST00000420138 TAF1P21675 1872 aa25.24■■□□□ 1.63
GPC1-202ENST00000420138 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
GPC1-202ENST00000420138 SERPINB2P05120 415 aa25.23■■□□□ 1.63
GPC1-202ENST00000420138 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
GPC1-202ENST00000420138 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
GPC1-202ENST00000420138 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa25.23■■□□□ 1.63
GPC1-202ENST00000420138 NLGN1Q8N2Q7 840 aa25.23■■□□□ 1.63
GPC1-202ENST00000420138 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa25.23■■□□□ 1.63
GPC1-202ENST00000420138 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
GPC1-202ENST00000420138 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
GPC1-202ENST00000420138 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
GPC1-202ENST00000420138 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.22■■□□□ 1.63
GPC1-202ENST00000420138 HELLSQ9NRZ9 838 aa25.22■■□□□ 1.63
GPC1-202ENST00000420138 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.22■■□□□ 1.63
GPC1-202ENST00000420138 NEK4P51957 841 aa25.21■■□□□ 1.63
GPC1-202ENST00000420138 HMG20BQ9P0W2 317 aa25.21■■□□□ 1.63
GPC1-202ENST00000420138 ST18O60284 1047 aa25.21■■□□□ 1.63
GPC1-202ENST00000420138 NFKBIBQ15653 356 aa25.21■■□□□ 1.63
GPC1-202ENST00000420138 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
GPC1-202ENST00000420138 BCAMP50895 628 aa25.2■■□□□ 1.62
GPC1-202ENST00000420138 A0A1B0GUL6 1792 aa25.2■■□□□ 1.62
GPC1-202ENST00000420138 DDIT3P35638 169 aa25.19■■□□□ 1.62
GPC1-202ENST00000420138 RASGRF1Q13972 1273 aa25.19■■□□□ 1.62
GPC1-202ENST00000420138 UBE4AQ14139 1066 aa25.19■■□□□ 1.62
GPC1-202ENST00000420138 CRY2Q49AN0 593 aa25.19■■□□□ 1.62
GPC1-202ENST00000420138 CREB3L3Q68CJ9 461 aa25.19■■□□□ 1.62
GPC1-202ENST00000420138 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
GPC1-202ENST00000420138 MAST3O60307 1309 aa25.19■■□□□ 1.62
GPC1-202ENST00000420138 OSBP2Q969R2 916 aa25.19■■□□□ 1.62
GPC1-202ENST00000420138 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
GPC1-202ENST00000420138 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25.18■■□□□ 1.62
GPC1-202ENST00000420138 ST5P78524 1137 aa25.18■■□□□ 1.62
GPC1-202ENST00000420138 ZNF804BA4D1E1 1349 aa25.18■■□□□ 1.62
GPC1-202ENST00000420138 SLC27A2O14975 620 aa25.17■■□□□ 1.62
GPC1-202ENST00000420138 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
GPC1-202ENST00000420138 SPATA5Q8NB90 893 aa25.17■■□□□ 1.62
GPC1-202ENST00000420138 M0R2C6 588 aa25.16■■□□□ 1.62
GPC1-202ENST00000420138 GRAPQ13588 217 aa25.16■■□□□ 1.62
GPC1-202ENST00000420138 ADCK5Q3MIX3 580 aa25.16■■□□□ 1.62
GPC1-202ENST00000420138 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
GPC1-202ENST00000420138 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
GPC1-202ENST00000420138 TAF6LQ9Y6J9 622 aa25.16■■□□□ 1.62
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GPC1-202ENST00000420138 VPS53Q5VIR6 699 aa25.15■■□□□ 1.62
GPC1-202ENST00000420138 MSL1Q68DK7 614 aa25.15■■□□□ 1.62
GPC1-202ENST00000420138 SLC51AQ86UW1 340 aa25.15■■□□□ 1.62
GPC1-202ENST00000420138 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
GPC1-202ENST00000420138 TTC14Q96N46 770 aa25.14■■□□□ 1.62
GPC1-202ENST00000420138 ADD2P35612 726 aa25.14■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 KCNJ4P48050 445 aa25.14■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 IL27Q8NEV9 243 aa25.14■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 APPBP2Q92624 585 aa25.14■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 TM6SF1Q9BZW5 370 aa25.14■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 ANKRD2Q9GZV1 360 aa25.14■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.14■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 MMP10P09238 476 aa25.13■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 GYG1P46976 350 aa25.13■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 TSGA10IPQ3SY00 556 aa25.13■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 KLRK1P26718 216 aa25.12■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 DSCC1Q9BVC3 393 aa25.12■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa25.12■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.12■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 IRS2Q9Y4H2 1338 aa25.12■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 FOXP2O15409 715 aa25.12■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 MCM2P49736 904 aa25.12■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa25.11■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 CPA1P15085 419 aa25.11■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa25.11■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.11■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 IDH1O75874 414 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 UBE3CQ15386 1083 aa25.1■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 WASHC4Q2M389 1173 aa25.1■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 FBXO33Q7Z6M2 555 aa25.1■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
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