RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412333.1

MESTP4-201, Transcript of mesoderm specific transcript pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene MESTP4, Length 1,204 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESTP4-201ENST00000412333 SEC31BQ9NQW1 1179 aa14.61□□□□□ -0.07
MESTP4-201ENST00000412333 RPS8P62241 208 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
MESTP4-201ENST00000412333 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
MESTP4-201ENST00000412333 NFE2L2Q16236 605 aa14.6□□□□□ -0.07
MESTP4-201ENST00000412333 ARMC5Q96C12 935 aa14.6□□□□□ -0.07
MESTP4-201ENST00000412333 ERO1AQ96HE7 468 aa14.6□□□□□ -0.07
MESTP4-201ENST00000412333 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
MESTP4-201ENST00000412333 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.6□□□□□ -0.07
MESTP4-201ENST00000412333 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.59□□□□□ -0.07
MESTP4-201ENST00000412333 USP17L3A6NCW0 530 aa14.59□□□□□ -0.07
MESTP4-201ENST00000412333 USP17L4A6NCW7 530 aa14.59□□□□□ -0.07
MESTP4-201ENST00000412333 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
MESTP4-201ENST00000412333 CAP1Q01518 475 aa14.59□□□□□ -0.07
MESTP4-201ENST00000412333 USP17L1Q7RTZ2 530 aa14.59□□□□□ -0.07
MESTP4-201ENST00000412333 EFCC1Q9HA90 598 aa14.59□□□□□ -0.07
MESTP4-201ENST00000412333 PODXL2Q9NZ53 605 aa14.59□□□□□ -0.07
MESTP4-201ENST00000412333 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 WNT10BO00744 389 aa14.58□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 CRHR2Q13324 411 aa14.58□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 CLMNQ96JQ2 1002 aa14.58□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 CHPF2Q9P2E5 772 aa14.58□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 CLSPNQ9HAW4 1339 aa14.58□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 OTOFQ9HC10 1997 aa14.58□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 KRT24Q2M2I5 525 aa14.57□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.57□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 OTUD5Q96G74 571 aa14.57□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 ZNF333Q96JL9 665 aa14.57□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa14.57□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 SSC5DA1L4H1 1573 aa14.56□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.56□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 LDLRAD1Q5T700 205 aa14.56□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 OGFOD1Q8N543 542 aa14.56□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 SLC10A4Q96EP9 437 aa14.56□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 WNK4Q96J92 1243 aa14.56□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.55□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 PLEKHF1Q96S99 279 aa14.55□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 ISCA1Q9BUE6 129 aa14.55□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa14.55□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 XDHP47989 1333 aa14.55□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 LAMA3Q16787 3333 aa14.55□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 SP3Q02447 781 aa14.54□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 DACT2Q5SW24 774 aa14.54□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 PLBD2Q8NHP8 589 aa14.54□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 PODNQ7Z5L7 613 aa14.53□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 KIAA0825Q8IV33 1275 aa14.53□□□□□ -0.08
MESTP4-201ENST00000412333 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 INHBEP58166 350 aa14.52□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.52□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 SH3TC2Q8TF17 1288 aa14.52□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 DPF3Q92784 378 aa14.52□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 MED23Q9ULK4 1368 aa14.51□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 ATP2B4P23634 1241 aa14.51□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 GJA5P36382 358 aa14.51□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.51□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa14.51□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa14.51□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 MYH3P11055 1940 aa14.51□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 UNC80Q8N2C7 3258 aa14.5□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 MYO3BQ8WXR4 1341 aa14.5□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.5□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 NBPF11Q86T75 865 aa14.5□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 PTPN18Q99952 460 aa14.5□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 DEFB129Q9H1M3 183 aa14.5□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 RIPK4P57078 832 aa14.49□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa14.49□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 CLRN2A0PK11 232 aa14.48□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 KLRK1P26718 216 aa14.48□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 STRIP1Q5VSL9 837 aa14.48□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 ELP3Q9H9T3 547 aa14.48□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 RIC3Q7Z5B4 369 aa14.47□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 TXNRD3Q86VQ6 643 aa14.47□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 SHISA4Q96DD7 197 aa14.47□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 MYD88Q99836 296 aa14.47□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa14.47□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 VEZTQ9HBM0 779 aa14.47□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 PDE8AO60658 829 aa14.46□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 GTF2IP78347 998 aa14.46□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 DLGAP5Q15398 846 aa14.46□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 MAP3K11Q16584 847 aa14.46□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 OPTNQ96CV9 577 aa14.46□□□□□ -0.09
MESTP4-201ENST00000412333 F8W031 263 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
MESTP4-201ENST00000412333 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
MESTP4-201ENST00000412333 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
MESTP4-201ENST00000412333 CCT4P50991 539 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
MESTP4-201ENST00000412333 GOLGA2Q08379 1002 aa14.45□□□□□ -0.1
MESTP4-201ENST00000412333 TTLL5Q6EMB2 1281 aa14.45□□□□□ -0.1
MESTP4-201ENST00000412333 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
MESTP4-201ENST00000412333 LRCH3Q96II8 777 aa14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms