RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409664.5

CSRNP3-204, Transcript of cysteine and serine rich nuclear protein 3, human

TSL 5

Gene CSRNP3, Length 482 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSRNP3-204	ENST00000409664	PDE1A	P54750	535 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CSRNP3-204	ENST00000409664	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CSRNP3-204	ENST00000409664	CNKSR1	Q969H4	720 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CSRNP3-204	ENST00000409664	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
CSRNP3-204	ENST00000409664	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
CSRNP3-204	ENST00000409664	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CSRNP3-204	ENST00000409664	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CSRNP3-204	ENST00000409664	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
CSRNP3-204	ENST00000409664	CACNA1S	Q13698	1873 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CSRNP3-204	ENST00000409664	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CSRNP3-204	ENST00000409664	C21orf2	O43822	256 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CSRNP3-204	ENST00000409664	UBE4A	Q14139	1066 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CSRNP3-204	ENST00000409664	ATP2B3	Q16720	1220 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CSRNP3-204	ENST00000409664	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CSRNP3-204	ENST00000409664	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CSRNP3-204	ENST00000409664	TTLL6	Q8N841	843 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CSRNP3-204	ENST00000409664	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CSRNP3-204	ENST00000409664	SYT17	Q9BSW7	474 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CSRNP3-204	ENST00000409664	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	LTBP1	Q14766	1721 aa		11.21	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	ZNF609	O15014	1411 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	PHKA1	P46020	1223 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	BCAM	P50895	628 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	SCARF1	Q14162	830 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	LPIN2	Q92539	896 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	PIM2	Q9P1W9	311 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	MX1	P20591	662 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	GYG1	P46976	350 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	PRELP	P51888	382 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	XDH	P47989	1333 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	ATP5J	P18859	108 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	CCDC102B	Q68D86	513 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	TMC4	Q7Z404	712 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	MPND	Q8N594	471 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	ATP2B4	P23634	1241 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	TTC22	Q5TAA0	569 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	PI16	Q6UXB8	463 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	GGA1	Q9UJY5	639 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	CHD4	Q14839	1912 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	RIMBP2	O15034	1052 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	UFL1	O94874	794 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	CHGB	P05060	677 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	SLC5A1	P13866	664 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	MCAM	P43121	646 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	SNRK	Q9NRH2	765 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	BCS1L	Q9Y276	419 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	C6orf229	H3BNL8	230 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	NFKBIE	O00221	500 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	SDS	P20132	328 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CSRNP3-204	ENST00000409664	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		11.15	□□□□□ -0.63
CSRNP3-204	ENST00000409664	COL4A5	P29400	1685 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRNP3-204	ENST00000409664	AOX1	Q06278	1338 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRNP3-204	ENST00000409664	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CSRNP3-204	ENST00000409664	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CSRNP3-204	ENST00000409664	ZAP70	P43403	619 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRNP3-204	ENST00000409664	RASGRF1	Q13972	1273 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRNP3-204	ENST00000409664	GRIK5	Q16478	980 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRNP3-204	ENST00000409664	DOK7	Q18PE1	504 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRNP3-204	ENST00000409664	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRNP3-204	ENST00000409664	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRNP3-204	ENST00000409664	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63
CSRNP3-204	ENST00000409664	HAUS7	Q99871	368 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRNP3-204	ENST00000409664	CD209	Q9NNX6	404 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRNP3-204	ENST00000409664	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CSRNP3-204	ENST00000409664	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRNP3-204	ENST00000409664	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CSRNP3-204	ENST00000409664	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63

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