RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
HOXD12-201ENST00000404162 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
HOXD12-201ENST00000404162 SASH1O94885 1247 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXD12-201ENST00000404162 SPRYD7Q5W111 196 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXD12-201ENST00000404162 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXD12-201ENST00000404162 OGFOD1Q8N543 542 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXD12-201ENST00000404162 FBXW7Q969H0 707 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM17Q9Y577 477 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXD12-201ENST00000404162 GOLGA2Q08379 1002 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXD12-201ENST00000404162 LDLRAD1Q5T700 205 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC191Q8NCU4 936 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXD12-201ENST00000404162 FZD1Q9UP38 647 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXD12-201ENST00000404162 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
HOXD12-201ENST00000404162 MED23Q9ULK4 1368 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD12-201ENST00000404162 OTOP1Q7RTM1 612 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXD12-201ENST00000404162 HTTP42858 3142 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXD12-201ENST00000404162 ALDH1A1P00352 501 aa25■■□□□ 1.59
HOXD12-201ENST00000404162 STRIP1Q5VSL9 837 aa25■■□□□ 1.59
HOXD12-201ENST00000404162 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
HOXD12-201ENST00000404162 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
HOXD12-201ENST00000404162 MINPP1Q9UNW1 487 aa25■■□□□ 1.59
HOXD12-201ENST00000404162 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
HOXD12-201ENST00000404162 IFNL1Q8IU54 200 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXD12-201ENST00000404162 MYO3BQ8WXR4 1341 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXD12-201ENST00000404162 SPEF2Q9C093 1822 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXD12-201ENST00000404162 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
HOXD12-201ENST00000404162 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXD12-201ENST00000404162 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
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HOXD12-201ENST00000404162 COA1Q9GZY4 146 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXD12-201ENST00000404162 MBIPQ9NS73 344 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXD12-201ENST00000404162 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP24.96■■□□□ 1.59
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HOXD12-201ENST00000404162 KIAA0825Q8IV33 1275 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXD12-201ENST00000404162 RUNDC1Q96C34 613 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXD12-201ENST00000404162 SLC10A4Q96EP9 437 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXD12-201ENST00000404162 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
HOXD12-201ENST00000404162 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
HOXD12-201ENST00000404162 CENPFP49454 3210 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXD12-201ENST00000404162 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
HOXD12-201ENST00000404162 CTSWP56202 376 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXD12-201ENST00000404162 TTLL5Q6EMB2 1281 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXD12-201ENST00000404162 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXD12-201ENST00000404162 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
HOXD12-201ENST00000404162 GREM2Q9H772 168 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXD12-201ENST00000404162 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXD12-201ENST00000404162 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
HOXD12-201ENST00000404162 EN2P19622 333 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
HOXD12-201ENST00000404162 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.58
HOXD12-201ENST00000404162 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXD12-201ENST00000404162 CLMNQ96JQ2 1002 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXD12-201ENST00000404162 MMP14P50281 582 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD12-201ENST00000404162 MAP3K11Q16584 847 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD12-201ENST00000404162 WNK4Q96J92 1243 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD12-201ENST00000404162 KLRK1P26718 216 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXD12-201ENST00000404162 DEFB129Q9H1M3 183 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXD12-201ENST00000404162 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
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HOXD12-201ENST00000404162 ERO1AQ96HE7 468 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD12-201ENST00000404162 LEMD3Q9Y2U8 911 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD12-201ENST00000404162 SSC5DA1L4H1 1573 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD12-201ENST00000404162 LAMB1P07942 1786 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF853P0CG23 659 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXD12-201ENST00000404162 CAP1Q01518 475 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXD12-201ENST00000404162 RALBP1Q15311 655 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXD12-201ENST00000404162 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
HOXD12-201ENST00000404162 MYH3P11055 1940 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXD12-201ENST00000404162 IGKV5-2P06315 115 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXD12-201ENST00000404162 ARMC5Q96C12 935 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXD12-201ENST00000404162 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXD12-201ENST00000404162 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXD12-201ENST00000404162 BRCA2P51587 3418 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF804BA4D1E1 1349 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXD12-201ENST00000404162 GJA5P36382 358 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXD12-201ENST00000404162 CRHR2Q13324 411 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXD12-201ENST00000404162 EFCC1Q9HA90 598 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXD12-201ENST00000404162 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
HOXD12-201ENST00000404162 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
HOXD12-201ENST00000404162 DLGAP5Q15398 846 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXD12-201ENST00000404162 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXD12-201ENST00000404162 PTPN18Q99952 460 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXD12-201ENST00000404162 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXD12-201ENST00000404162 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
HOXD12-201ENST00000404162 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
HOXD12-201ENST00000404162 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
HOXD12-201ENST00000404162 SP3Q02447 781 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXD12-201ENST00000404162 CERS5Q8N5B7 392 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXD12-201ENST00000404162 USP2O75604 605 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
HOXD12-201ENST00000404162 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.84■■□□□ 1.57
HOXD12-201ENST00000404162 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
HOXD12-201ENST00000404162 MTMR14Q8NCE2 650 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXD12-201ENST00000404162 CD209Q9NNX6 404 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXD12-201ENST00000404162 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXD12-201ENST00000404162 ECM29Q5VYK3 1845 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXD12-201ENST00000404162 CLRN2A0PK11 232 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXD12-201ENST00000404162 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXD12-201ENST00000404162 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
HOXD12-201ENST00000404162 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXD12-201ENST00000404162 KSR2Q6VAB6 950 aa24.83■■□□□ 1.57
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