RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 HYPKQ9NX55 129 aa10.98□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 MCM8Q9UJA3 840 aa10.98□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 A0A1B0GUA9 196 aa10.98□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 VWA3AA6NCI4 1184 aa10.98□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 ENO4A6NNW6 628 aa10.98□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 CHUKO15111 745 aa10.98□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 PPFIA3O75145 1194 aa10.98□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 INHBEP58166 350 aa10.98□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 VSNL1P62760 191 aa10.98□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP10.98□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 ADCK5Q3MIX3 580 aa10.98□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 ZBTB10Q96DT7 871 aa10.98□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 LRRCC1Q9C099 1032 aa10.98□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa10.98□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 SNX1Q13596 522 aa10.97□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 IGSF22Q8N9C0 903 aa10.97□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 TAOK2Q9UL54 1235 aa10.97□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 L1RE1Q9UN81 338 aa10.97□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 PDCP20941 246 aa10.97□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 KCND1Q9NSA2 647 aa10.97□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 PPP6R1Q9UPN7 881 aa10.97□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 C21orf2O43822 256 aa10.97□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 CDR1P51861 262 aa10.97□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa10.97□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 CEP85LQ5SZL2 805 aa10.97□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 KAT14Q9H8E8 782 aa10.97□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa10.97□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 ERCC3P19447 782 aa10.96□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 ME1P48163 572 aa10.96□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 C11orf91Q3C1V1 193 aa10.96□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 FSIP1Q8NA03 581 aa10.96□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 ARMC2Q8NEN0 867 aa10.96□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 PARD3BQ8TEW8 1205 aa10.96□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 SIL1Q9H173 461 aa10.96□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 ETAA1Q9NY74 926 aa10.96□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 TTC21AQ8NDW8 1320 aa10.96□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 REREQ9P2R6 1566 aa10.96□□□□□ -0.65
TMOD1-203ENST00000395211 ATP1A3P13637 1013 aa10.96□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 PPARDQ03181 441 aa10.96□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 DCTN1Q14203 1278 aa10.96□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 DPCR1Q3MIW9 517 aa10.96□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 BORCS6Q96GS4 357 aa10.96□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 SHPRHQ149N8 1683 aa10.96□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 MSH6P52701 1360 aa10.96□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 CHGAP10645 457 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 TOP1P11387 765 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 STAG1Q8WVM7 1258 aa10.96□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 HINFPQ9BQA5 517 aa10.96□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 POLD4Q9HCU8 107 aa10.96□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa10.95□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 F6X3S4 739 aa10.95□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 UBASH3AP57075 661 aa10.95□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 FANCCQ00597 558 aa10.95□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 PSME1Q06323 249 aa10.95□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa10.95□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 CEP112Q8N8E3 955 aa10.95□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 FAM76AQ8TAV0 307 aa10.95□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 TPCN1Q9ULQ1 816 aa10.95□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 CLTCL1P53675 1640 aa10.95□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 GNGT1P63211 74 aa10.95□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 ST3GAL1Q11201 340 aa10.95□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa10.95□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 NDUFAB1O14561 156 aa10.94□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 CTAGE5O15320 804 aa10.94□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 SGSM2O43147 1006 aa10.94□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 RAB11FIP3O75154 756 aa10.94□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 MYBL2P10244 700 aa10.94□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 FBLN1P23142 703 aa10.94□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa10.94□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 SPDL1Q96EA4 605 aa10.94□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 PTCH1Q13635 1447 aa10.94□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 FAM135BQ49AJ0 1406 aa10.94□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 CRYMQ14894 314 aa10.94□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 KCNB2Q92953 911 aa10.94□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 SH3GL3Q99963 347 aa10.94□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 CRACR2AQ9BSW2 395 aa10.94□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 OSBPL3Q9H4L5 887 aa10.94□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 FAM83GA6ND36 823 aa10.94□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 PLEKHD1A6NEE1 506 aa10.94□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 CUTAO60888 179 aa10.94□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 ZMYND10O75800 440 aa10.94□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF202O95125 648 aa10.94□□□□□ -0.66
TMOD1-203ENST00000395211 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.3 ms