RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 USP17L1Q7RTZ2 530 aa29.75■■■□□ 2.35
FAAP20-201ENST00000378543 USP48Q86UV5 1035 aa29.75■■■□□ 2.35
FAAP20-201ENST00000378543 GMLQ99445 158 aa29.75■■■□□ 2.35
FAAP20-201ENST00000378543 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa29.74■■■□□ 2.35
FAAP20-201ENST00000378543 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
FAAP20-201ENST00000378543 DLK2Q6UY11 383 aa29.73■■■□□ 2.35
FAAP20-201ENST00000378543 SUCLG2Q96I99 432 aa29.73■■■□□ 2.35
FAAP20-201ENST00000378543 COA1Q9GZY4 146 aa29.73■■■□□ 2.35
FAAP20-201ENST00000378543 TLL2Q9Y6L7 1015 aa29.73■■■□□ 2.35
FAAP20-201ENST00000378543 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
FAAP20-201ENST00000378543 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
FAAP20-201ENST00000378543 KAZALD1Q96I82 304 aa29.72■■■□□ 2.35
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF408Q9H9D4 720 aa29.72■■■□□ 2.35
FAAP20-201ENST00000378543 PTPRCP08575 1304 aa29.71■■■□□ 2.35
FAAP20-201ENST00000378543 SNAP23O00161 211 aa29.71■■■□□ 2.35
FAAP20-201ENST00000378543 TAF5LO75529 589 aa29.71■■■□□ 2.35
FAAP20-201ENST00000378543 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC57Q2TAC2 916 aa29.71■■■□□ 2.35
FAAP20-201ENST00000378543 ALDH1L2Q3SY69 923 aa29.71■■■□□ 2.35
FAAP20-201ENST00000378543 KCNJ4P48050 445 aa29.7■■■□□ 2.35
FAAP20-201ENST00000378543 DACT2Q5SW24 774 aa29.7■■■□□ 2.35
FAAP20-201ENST00000378543 MXD3Q9BW11 206 aa29.7■■■□□ 2.35
FAAP20-201ENST00000378543 UTYO14607 1347 aa29.7■■■□□ 2.34
FAAP20-201ENST00000378543 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.34
FAAP20-201ENST00000378543 USP17L8P0C7I0 530 aa29.69■■■□□ 2.34
FAAP20-201ENST00000378543 CYP4F22Q6NT55 531 aa29.69■■■□□ 2.34
FAAP20-201ENST00000378543 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
FAAP20-201ENST00000378543 KRT26Q7Z3Y9 468 aa29.69■■■□□ 2.34
FAAP20-201ENST00000378543 TAF7LQ5H9L4 462 aa29.68■■■□□ 2.34
FAAP20-201ENST00000378543 SAPCD2Q86UD0 394 aa29.68■■■□□ 2.34
FAAP20-201ENST00000378543 FBXW7Q969H0 707 aa29.68■■■□□ 2.34
FAAP20-201ENST00000378543 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
FAAP20-201ENST00000378543 CAPNS2Q96L46 248 aa29.68■■■□□ 2.34
FAAP20-201ENST00000378543 ADM5C9JUS6 153 aa29.67■■■□□ 2.34
FAAP20-201ENST00000378543 STRIP1Q5VSL9 837 aa29.67■■■□□ 2.34
FAAP20-201ENST00000378543 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa29.67■■■□□ 2.34
FAAP20-201ENST00000378543 GGA3Q9NZ52 723 aa29.67■■■□□ 2.34
FAAP20-201ENST00000378543 IRS2Q9Y4H2 1338 aa29.67■■■□□ 2.34
FAAP20-201ENST00000378543 FOXN1O15353 648 aa29.66■■■□□ 2.34
FAAP20-201ENST00000378543 MYOZ2Q9NPC6 264 aa29.66■■■□□ 2.34
FAAP20-201ENST00000378543 WBP1LQ9NX94 342 aa29.66■■■□□ 2.34
FAAP20-201ENST00000378543 ECE1P42892 770 aa29.65■■■□□ 2.34
FAAP20-201ENST00000378543 GRM1Q13255 1194 aa29.65■■■□□ 2.34
FAAP20-201ENST00000378543 SCARF1Q14162 830 aa29.65■■■□□ 2.34
FAAP20-201ENST00000378543 CNNM1Q9NRU3 951 aa29.65■■■□□ 2.34
FAAP20-201ENST00000378543 SMC4Q9NTJ3 1288 aa29.65■■■□□ 2.34
FAAP20-201ENST00000378543 THSD7BQ9C0I4 1608 aa29.64■■■□□ 2.34
FAAP20-201ENST00000378543 TTLL5Q6EMB2 1281 aa29.64■■■□□ 2.34
FAAP20-201ENST00000378543 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
FAAP20-201ENST00000378543 CD209Q9NNX6 404 aa29.64■■■□□ 2.34
FAAP20-201ENST00000378543 PLIN1O60240 522 aa29.63■■■□□ 2.33
FAAP20-201ENST00000378543 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
FAAP20-201ENST00000378543 GTF2IP78347 998 aa29.62■■■□□ 2.33
FAAP20-201ENST00000378543 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
FAAP20-201ENST00000378543 SULF1Q8IWU6 871 aa29.62■■■□□ 2.33
FAAP20-201ENST00000378543 MYO3BQ8WXR4 1341 aa29.62■■■□□ 2.33
FAAP20-201ENST00000378543 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
FAAP20-201ENST00000378543 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
FAAP20-201ENST00000378543 ANKRD44Q8N8A2 993 aa29.61■■■□□ 2.33
FAAP20-201ENST00000378543 AIDAQ96BJ3 306 aa29.61■■■□□ 2.33
FAAP20-201ENST00000378543 HHIPL1Q96JK4 782 aa29.61■■■□□ 2.33
FAAP20-201ENST00000378543 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
FAAP20-201ENST00000378543 USP44Q9H0E7 712 aa29.61■■■□□ 2.33
FAAP20-201ENST00000378543 OGFOD1Q8N543 542 aa29.59■■■□□ 2.33
FAAP20-201ENST00000378543 AOC2O75106 756 aa29.58■■■□□ 2.33
FAAP20-201ENST00000378543 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
FAAP20-201ENST00000378543 NBPF9Q3BBW0 867 aa29.58■■■□□ 2.33
FAAP20-201ENST00000378543 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
FAAP20-201ENST00000378543 HUNKP57058 714 aa29.57■■■□□ 2.32
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF804AQ7Z570 1209 aa29.57■■■□□ 2.32
FAAP20-201ENST00000378543 KIAA0825Q8IV33 1275 aa29.57■■■□□ 2.32
FAAP20-201ENST00000378543 CDCA5Q96FF9 252 aa29.57■■■□□ 2.32
FAAP20-201ENST00000378543 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
FAAP20-201ENST00000378543 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa29.57■■■□□ 2.32
FAAP20-201ENST00000378543 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa29.56■■■□□ 2.32
FAAP20-201ENST00000378543 IL1R1P14778 569 aa29.56■■■□□ 2.32
FAAP20-201ENST00000378543 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
FAAP20-201ENST00000378543 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP29.56■■■□□ 2.32
FAAP20-201ENST00000378543 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
FAAP20-201ENST00000378543 WNT10BO00744 389 aa29.55■■■□□ 2.32
FAAP20-201ENST00000378543 TNS4Q8IZW8 715 aa29.55■■■□□ 2.32
FAAP20-201ENST00000378543 C2orf69Q8N8R5 385 aa29.55■■■□□ 2.32
FAAP20-201ENST00000378543 MAP2K2P36507 400 aa29.54■■■□□ 2.32
FAAP20-201ENST00000378543 UBE4AQ14139 1066 aa29.54■■■□□ 2.32
FAAP20-201ENST00000378543 CERS5Q8N5B7 392 aa29.54■■■□□ 2.32
FAAP20-201ENST00000378543 SASH1O94885 1247 aa29.53■■■□□ 2.32
FAAP20-201ENST00000378543 MMP14P50281 582 aa29.53■■■□□ 2.32
FAAP20-201ENST00000378543 LRRC24Q50LG9 513 aa29.53■■■□□ 2.32
FAAP20-201ENST00000378543 HDAC9Q9UKV0 1011 aa29.53■■■□□ 2.32
FAAP20-201ENST00000378543 RARSP54136 660 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
FAAP20-201ENST00000378543 PRDM10Q9NQV6 1147 aa29.52■■■□□ 2.32
FAAP20-201ENST00000378543 MROH5Q6ZUA9 1318 aa29.51■■■□□ 2.32
FAAP20-201ENST00000378543 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
FAAP20-201ENST00000378543 LBX1P52954 281 aa29.51■■■□□ 2.31
FAAP20-201ENST00000378543 KLHDC4Q8TBB5 520 aa29.51■■■□□ 2.31
FAAP20-201ENST00000378543 JAG2Q9Y219 1238 aa29.51■■■□□ 2.31
FAAP20-201ENST00000378543 RGMBQ6NW40 437 aa29.5■■■□□ 2.31
FAAP20-201ENST00000378543 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms