RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366391.6

SH3BP5-201, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-201ENST00000366391 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5-201ENST00000366391 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5-201ENST00000366391 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5-201ENST00000366391 COA1Q9GZY4 146 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5-201ENST00000366391 IRS2Q9Y4H2 1338 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP5-201ENST00000366391 USP17L3A6NCW0 530 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP5-201ENST00000366391 USP17L4A6NCW7 530 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP5-201ENST00000366391 TRIM27P14373 513 aa23.19■■□□□ 1.3
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SH3BP5-201ENST00000366391 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP5-201ENST00000366391 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP5-201ENST00000366391 TRPM4Q8TD43 1214 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP5-201ENST00000366391 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
SH3BP5-201ENST00000366391 PLIN1O60240 522 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP5-201ENST00000366391 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
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SH3BP5-201ENST00000366391 TNNQ9UQP3 1299 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP5-201ENST00000366391 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP5-201ENST00000366391 SAMD7Q7Z3H4 446 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP5-201ENST00000366391 AGBL3Q8NEM8 1001 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP5-201ENST00000366391 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP5-201ENST00000366391 MEIS3Q99687 375 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP5-201ENST00000366391 PGAP2Q9UHJ9 254 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP5-201ENST00000366391 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.15■■□□□ 1.3
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SH3BP5-201ENST00000366391 LRRC24Q50LG9 513 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP5-201ENST00000366391 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23.15■■□□□ 1.3
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SH3BP5-201ENST00000366391 CD209Q9NNX6 404 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP5-201ENST00000366391 CREBZFQ9NS37 354 aa23.15■■□□□ 1.3
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SH3BP5-201ENST00000366391 DACT2Q5SW24 774 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP5-201ENST00000366391 STRIP1Q5VSL9 837 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP5-201ENST00000366391 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP5-201ENST00000366391 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP5-201ENST00000366391 KLRG1Q96E93 195 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP5-201ENST00000366391 UBE4AQ14139 1066 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP5-201ENST00000366391 FBXW7Q969H0 707 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
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SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP5-201ENST00000366391 MXD3Q9BW11 206 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP5-201ENST00000366391 MYO3BQ8WXR4 1341 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP5-201ENST00000366391 TMEM88BA6NKF7 163 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP5-201ENST00000366391 GNAI3P08754 354 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP5-201ENST00000366391 USP17L8P0C7I0 530 aa23.11■■□□□ 1.29
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SH3BP5-201ENST00000366391 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP23.11■■□□□ 1.29
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SH3BP5-201ENST00000366391 IL1R1P14778 569 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP5-201ENST00000366391 GTF2IP78347 998 aa23.1■■□□□ 1.29
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SH3BP5-201ENST00000366391 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.09■■□□□ 1.29
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SH3BP5-201ENST00000366391 PDE8BO95263 885 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP5-201ENST00000366391 CDC37L1Q7L3B6 337 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP5-201ENST00000366391 GYG1P46976 350 aa23.07■■□□□ 1.28
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SH3BP5-201ENST00000366391 FBXO3Q9UK99 471 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP5-201ENST00000366391 OGFOD1Q8N543 542 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP5-201ENST00000366391 JMYQ8N9B5 988 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP5-201ENST00000366391 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SH3BP5-201ENST00000366391 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SH3BP5-201ENST00000366391 SIL1Q9H173 461 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP5-201ENST00000366391 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SH3BP5-201ENST00000366391 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
SH3BP5-201ENST00000366391 CNTNAP1P78357 1384 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP5-201ENST00000366391 CIAO1O76071 339 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP5-201ENST00000366391 MTX1Q13505 466 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP5-201ENST00000366391 CST9Q5W186 159 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP5-201ENST00000366391 USP48Q86UV5 1035 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP5-201ENST00000366391 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP5-201ENST00000366391 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
SH3BP5-201ENST00000366391 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
SH3BP5-201ENST00000366391 CERS5Q8N5B7 392 aa23.04■■□□□ 1.28
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SH3BP5-201ENST00000366391 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
SH3BP5-201ENST00000366391 SASH1O94885 1247 aa23.03■■□□□ 1.28
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SH3BP5-201ENST00000366391 FGFR2P21802 821 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP5-201ENST00000366391 MMP14P50281 582 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP5-201ENST00000366391 SCARF1Q14162 830 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP5-201ENST00000366391 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
SH3BP5-201ENST00000366391 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP5-201ENST00000366391 FBXO33Q7Z6M2 555 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP5-201ENST00000366391 COPRSQ9NQ92 184 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP5-201ENST00000366391 FAM205AQ6ZU69 1335 aa23.03■■□□□ 1.28
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