RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 EFCC1Q9HA90 598 aa19.57■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 TMEM94Q12767 1356 aa19.57■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 MYO1CO00159 1063 aa19.57■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 CCDC191Q8NCU4 936 aa19.57■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 LINS1Q8NG48 757 aa19.57■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 KLHDC4Q8TBB5 520 aa19.57■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 SLC52A2Q9HAB3 445 aa19.57■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 RESTQ13127 1097 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 HOMER1Q86YM7 354 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 JAK2O60674 1132 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 DDX58O95786 925 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 PHKG2P15735 406 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 ARMCX5Q6P1M9 558 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 AACSQ86V21 672 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 ANO10Q9NW15 660 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 CTAGE5O15320 804 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 SASH3O75995 380 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 GPS2Q13227 327 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 MTX1Q13505 466 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 CEP57L1Q8IYX8 460 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 MNS1Q8NEH6 495 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 XAGE3Q8WTP9 111 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 UBXN6Q9BZV1 441 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 DNAI1Q9UI46 699 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 IGKV5-2P06315 115 aa19.55■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 PSMA5P28066 241 aa19.55■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa19.55■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 TMX1Q9H3N1 280 aa19.55■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa19.55■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 MEGF6O75095 1541 aa19.55■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 COPS6Q7L5N1 327 aa19.55■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 BRF1Q92994 677 aa19.55■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 SLC27A2O14975 620 aa19.54■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP19.54■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 TMC6Q7Z403 805 aa19.54■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 IMPACTQ9P2X3 320 aa19.54■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa19.54■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 TBC1D8O95759 1140 aa19.54■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 ETF1P62495 437 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 CCDC150Q8NCX0 1101 aa19.54■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 CCDC34Q96HJ3 373 aa19.54■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 MYD88Q99836 296 aa19.54■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 TAF6LQ9Y6J9 622 aa19.54■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 TTC41PQ6P2S7 1318 aa19.54■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 TADA3O75528 432 aa19.53■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 ANKRD1Q15327 319 aa19.53■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP19.53■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 ECHDC1Q9NTX5 307 aa19.53■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa19.53■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa19.53■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 SMC2O95347 1197 aa19.53■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 FAM227BQ96M60 508 aa19.53■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 EPC1Q9H2F5 836 aa19.53■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 CFAP45Q9UL16 551 aa19.53■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 KINO60870 393 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 SASH1O94885 1247 aa19.53■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 NOP2P46087 812 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 MST1RQ04912 1400 aa19.53■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 KIF1AQ12756 1690 aa19.52■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 H3BQV1 296 aa19.52■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 RPS6KB1P23443 525 aa19.52■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 IFFO2Q5TF58 517 aa19.52■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa19.52■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 MAP4K1Q92918 833 aa19.52■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 CARD6Q9BX69 1037 aa19.52■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 ALS2Q96Q42 1657 aa19.52■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 CYP27B1O15528 508 aa19.52■□□□□ 0.71
GDE1-201ENST00000353258 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.71
GDE1-201ENST00000353258 GYS2P54840 703 aa19.52■□□□□ 0.71
GDE1-201ENST00000353258 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP19.52■□□□□ 0.71
GDE1-201ENST00000353258 IFNL2Q8IZJ0 200 aa19.52■□□□□ 0.71
GDE1-201ENST00000353258 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.71
GDE1-201ENST00000353258 URI1O94763 535 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
GDE1-201ENST00000353258 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
GDE1-201ENST00000353258 C5P01031 1676 aa19.51■□□□□ 0.71
GDE1-201ENST00000353258 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa19.51■□□□□ 0.71
GDE1-201ENST00000353258 ATP8B1O43520 1251 aa19.51■□□□□ 0.71
GDE1-201ENST00000353258 CASQ1P31415 396 aa19.51■□□□□ 0.71
GDE1-201ENST00000353258 EPHA10Q5JZY3 1008 aa19.51■□□□□ 0.71
GDE1-201ENST00000353258 IFNKQ9P0W0 207 aa19.51■□□□□ 0.71
GDE1-201ENST00000353258 FANCGO15287 622 aa19.5■□□□□ 0.71
GDE1-201ENST00000353258 TUBB4AP04350 444 aa19.5■□□□□ 0.71
GDE1-201ENST00000353258 HSPA2P54652 639 aa19.5■□□□□ 0.71
GDE1-201ENST00000353258 TTC5Q8N0Z6 440 aa19.5■□□□□ 0.71
GDE1-201ENST00000353258 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
GDE1-201ENST00000353258 KCNJ6P48051 423 aa19.5■□□□□ 0.71
GDE1-201ENST00000353258 NEXNQ0ZGT2 675 aa19.5■□□□□ 0.71
GDE1-201ENST00000353258 CCDC158Q5M9N0 1113 aa19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 120.6 ms