RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 IL17REQ8NFR9 667 aa23.82■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 NYXQ9GZU5 481 aa23.82■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 DNAJC25Q9H1X3 360 aa23.82■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 PREX2Q70Z35 1606 aa23.82■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 SPTLC2O15270 562 aa23.82■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 KIF20AO95235 890 aa23.82■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 A1BGP04217 495 aa23.82■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.82■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 SNX14Q9Y5W7 946 aa23.82■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.82■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 GCKRQ14397 625 aa23.81■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 TMCO3Q6UWJ1 677 aa23.81■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 CCDC178Q5BJE1 867 aa23.81■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 METP08581 1390 aa23.81■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 SLC27A2O14975 620 aa23.81■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 FAM227BQ96M60 508 aa23.81■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.8■■□□□ 1.4
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NISCH-201ENST00000345716 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP23.8■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 AFMP43652 599 aa23.8■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
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NISCH-201ENST00000345716 FAM193AP78312 1265 aa23.79■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 CABP5Q9NP86 173 aa23.79■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 TYRO3Q06418 890 aa23.79■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 CCDC150Q8NCX0 1101 aa23.79■■□□□ 1.4
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NISCH-201ENST00000345716 UBASH3AP57075 661 aa23.78■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 H0YHG0 523 aa23.77■■□□□ 1.4
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NISCH-201ENST00000345716 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.77■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 KCNQ3O43525 872 aa23.77■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 RXRAP19793 462 aa23.77■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
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NISCH-201ENST00000345716 RTL1A6NKG5 1358 aa23.77■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.77■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 AOPEPQ8N6M6 819 aa23.77■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 USP44Q9H0E7 712 aa23.77■■□□□ 1.4
NISCH-201ENST00000345716 F8W031 263 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
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NISCH-201ENST00000345716 ZNF521Q96K83 1311 aa23.77■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 PLA2R1Q13018 1463 aa23.76■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.76■■□□□ 1.39
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NISCH-201ENST00000345716 CENPHQ9H3R5 247 aa23.76■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 GBP3Q9H0R5 595 aa23.76■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 TRIM75PA6NK02 468 aa23.76■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 MBD4O95243 580 aa23.76■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 XAGE2Q96GT9 111 aa23.76■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 EHMT1Q9H9B1 1298 aa23.76■■□□□ 1.39
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NISCH-201ENST00000345716 RTL9Q8NET4 1388 aa23.75■■□□□ 1.39
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NISCH-201ENST00000345716 CALM1P0DP23 149 aa23.75■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 CALM2P0DP24 149 aa23.75■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 CALM3P0DP25 149 aa23.75■■□□□ 1.39
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NISCH-201ENST00000345716 RMND1Q9NWS8 449 aa23.75■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 MCM9Q9NXL9 1143 aa23.75■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 USO1O60763 962 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
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NISCH-201ENST00000345716 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 CCDC40Q4G0X9 1142 aa23.75■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa23.75■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 VPS36Q86VN1 386 aa23.75■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 BRAPQ7Z569 592 aa23.74■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 TRIM47Q96LD4 638 aa23.74■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.74■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 FAM114A1Q8IWE2 563 aa23.74■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 CLCN1P35523 988 aa23.73■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 STAT6P42226 847 aa23.73■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 PICALMQ13492 652 aa23.73■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 KBTBD3Q8NAB2 608 aa23.73■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 SSH3Q8TE77 659 aa23.73■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa23.73■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa23.73■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 DNAJC10Q8IXB1 793 aa23.73■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.73■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa23.73■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 PDE8AO60658 829 aa23.72■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 PARP10Q53GL7 1025 aa23.72■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 EXOC1Q9NV70 894 aa23.72■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa23.72■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 SKILP12757 684 aa23.72■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP23.72■■□□□ 1.391e-6■■□□□ 14
NISCH-201ENST00000345716 TSPYL1Q9H0U9 437 aa23.72■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
NISCH-201ENST00000345716 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
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