RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343537.11

TP53BP2-201, Transcript of tumor protein p53 binding protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TP53BP2, Length 4,651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP2-201ENST00000343537 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.49■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 SSFA2P28290 1259 aa21.49■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 ABCA6Q8N139 1617 aa21.49■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 RTN1Q16799 776 aa21.49■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 TEX11Q8IYF3 940 aa21.49■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa21.49■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 GNAQP50148 359 aa21.49■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.49■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 TNS3Q68CZ2 1445 aa21.48■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 PDE6BP35913 854 aa21.48■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 TTC6Q86TZ1 520 aa21.48■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.48■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 HELLSQ9NRZ9 838 aa21.48■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 DIP2BQ9P265 1576 aa21.48■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 AFF2P51816 1311 aa21.48■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 SSH3Q8TE77 659 aa21.48■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 CHST3Q7LGC8 479 aa21.47■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 MPNDQ8N594 471 aa21.47■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 TMEM266Q2M3C6 531 aa21.47■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 NF2P35240 595 aa21.47■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 EHMT1Q9H9B1 1298 aa21.47■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 ZNF853P0CG23 659 aa21.46■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21.46■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 C8orf34Q49A92 452 aa21.46■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 CERKQ8TCT0 537 aa21.46■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 APPBP2Q92624 585 aa21.46■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.46■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa21.46■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 KBTBD3Q8NAB2 608 aa21.46■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa21.46■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.46■■□□□ 1.03
TP53BP2-201ENST00000343537 PTPRMP28827 1452 aa21.45■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.45■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 MAP3K11Q16584 847 aa21.45■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 TANGO6Q9C0B7 1094 aa21.45■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 CCDC39Q9UFE4 941 aa21.45■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 CAMK4Q16566 473 aa21.44■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 SUPT20HQ8NEM7 779 aa21.44■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 CHMP4BP1P59074 171 aa21.44■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 HEG1Q9ULI3 1381 aa21.44■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa21.44■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.44■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 TNNI2P48788 182 aa21.44■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 ALG1Q9BT22 464 aa21.44■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 ZAP70P43403 619 aa21.43■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 ARMT1Q9H993 441 aa21.43■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 TRAF1Q13077 416 aa21.43■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 CCDC70Q6NSX1 233 aa21.43■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 SPATA5Q8NB90 893 aa21.43■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 GDPD2Q9HCC8 539 aa21.43■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 BAG4O95429 457 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 MADDQ8WXG6 1647 aa21.42■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 AOX1Q06278 1338 aa21.42■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 RBM25P49756 843 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 SMARCE1Q969G3 411 aa21.42■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 ZNF521Q96K83 1311 aa21.42■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 GPAA1O43292 621 aa21.42■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 MAST3O60307 1309 aa21.41■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 EIF6P56537 245 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa21.41■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 FAM227BQ96M60 508 aa21.41■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 PTCH1Q13635 1447 aa21.41■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 USP31Q70CQ4 1352 aa21.41■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.41■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 BCS1LQ9Y276 419 aa21.41■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 ODF2Q5BJF6 829 aa21.4■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 PPIP5K2O43314 1243 aa21.4■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 CALM1P0DP23 149 aa21.4■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 CALM2P0DP24 149 aa21.4■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 CALM3P0DP25 149 aa21.4■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.4■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 USP26Q9BXU7 913 aa21.4■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 GREM2Q9H772 168 aa21.4■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 PALLDQ8WX93 1383 aa21.4■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 ATP5JP18859 108 aa21.4■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.4■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa21.4■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.4■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 SPC24Q8NBT2 197 aa21.39■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 CCDC148Q8NFR7 591 aa21.39■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
TP53BP2-201ENST00000343537 UBA7P41226 1012 aa21.39■■□□□ 1.01
TP53BP2-201ENST00000343537 AK2P54819 239 aa21.39■■□□□ 1.01
TP53BP2-201ENST00000343537 APOBRQ0VD83 1088 aa21.39■■□□□ 1.01
TP53BP2-201ENST00000343537 LRRC24Q50LG9 513 aa21.39■■□□□ 1.01
TP53BP2-201ENST00000343537 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa21.39■■□□□ 1.01
TP53BP2-201ENST00000343537 FSIP1Q8NA03 581 aa21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms