RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.63
PTDSS1-201ENST00000337004 MAST3O60307 1309 aa25.21■■□□□ 1.63
PTDSS1-201ENST00000337004 COL18A1P39060 1754 aa25.21■■□□□ 1.63
PTDSS1-201ENST00000337004 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
PTDSS1-201ENST00000337004 FOSBP53539 338 aa25.2■■□□□ 1.63
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 SALL1Q9NSC2 1324 aa25.2■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 STX1AQ16623 288 aa25.19■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 USP28Q96RU2 1077 aa25.19■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.19■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 CLIP2Q9UDT6 1046 aa25.19■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 TNS3Q68CZ2 1445 aa25.19■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.19■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 A1BGP04217 495 aa25.19■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 CDC25BP30305 580 aa25.19■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.19■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 CTNNA3Q9UI47 895 aa25.19■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 CPDO75976 1380 aa25.18■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.18■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.18■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.18■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 KINO60870 393 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa25.18■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 FBXL16Q8N461 479 aa25.18■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 NRBP1Q9UHY1 535 aa25.18■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 ZMYND15Q9H091 742 aa25.18■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.18■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 IQCB1Q15051 598 aa25.17■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.17■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 TSC1Q92574 1164 aa25.17■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 A0A0G2JLW4 131 aa25.17■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM160A1Q05DH4 1040 aa25.17■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 SARM1Q6SZW1 724 aa25.17■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 M0R2C6 588 aa25.16■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 ME1P48163 572 aa25.16■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 LRMPQ12912 555 aa25.16■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 CHST3Q7LGC8 479 aa25.16■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF710Q8N1W2 664 aa25.16■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa25.16■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 DCCP43146 1447 aa25.16■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.16■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 EVCP57679 992 aa25.16■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC57Q2TAC2 916 aa25.16■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 GORABQ5T7V8 394 aa25.16■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.16■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 AKAP2Q9Y2D5 859 aa25.16■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 OSBP2Q969R2 916 aa25.15■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.15■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 GLI3P10071 1580 aa25.15■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 BECN2A8MW95 431 aa25.15■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 ENGASEQ8NFI3 743 aa25.15■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 ANO10Q9NW15 660 aa25.15■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.14■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.14■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 TTLL5Q6EMB2 1281 aa25.14■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 FBXO3Q9UK99 471 aa25.14■■□□□ 1.62
PTDSS1-201ENST00000337004 GUCY1B3Q02153 619 aa25.13■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 FSIP1Q8NA03 581 aa25.13■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa25.13■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.13■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 WASHC4Q2M389 1173 aa25.12■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa25.12■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 RTEL1Q9NZ71 1219 aa25.12■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 PPFIA3O75145 1194 aa25.11■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 FDPSP14324 419 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 ARID3AQ99856 593 aa25.11■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 NEMFO60524 1076 aa25.11■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 XAGE2Q96GT9 111 aa25.11■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.11■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 ADALQ6DHV7 355 aa25.1■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 WDR17Q8IZU2 1322 aa25.1■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM177BA6PVY3 158 aa25.1■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC144BQ3MJ40 725 aa25.1■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa25.1■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 PCDHA7Q9UN72 937 aa25.1■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 TCIRG1Q13488 830 aa25.09■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 CEP57L1Q8IYX8 460 aa25.09■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 A0A1W2PQ27 194 aa25.09■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 A0A1W2PQ64 194 aa25.09■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 A0A1W2PQD8 194 aa25.09■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 CTIFO43310 598 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PTDSS1-201ENST00000337004 C8orf76Q96K31 380 aa25.09■■□□□ 1.61
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