RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 MCAMP43121 646 aa27.19■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 LRP5O75197 1615 aa27.19■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 A0A0G2JLW4 131 aa27.18■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 STK3Q13188 491 aa27.18■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 TCHHQ07283 1943 aa27.18■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 CNPY2Q9Y2B0 182 aa27.18■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 WASHC4Q2M389 1173 aa27.17■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 PARP10Q53GL7 1025 aa27.17■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 TMEM87AQ8NBN3 555 aa27.17■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa27.17■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 C8orf37Q96NL8 207 aa27.17■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 LAMA4Q16363 1823 aa27.16■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 AKAP11Q9UKA4 1901 aa27.15■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 NGLY1Q96IV0 654 aa27.15■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 LRRC2Q9BYS8 371 aa27.15■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP27.15■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 BCL9LQ86UU0 1499 aa27.15■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 MROH5Q6ZUA9 1318 aa27.15■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 APPBP2Q92624 585 aa27.15■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 E7EWF7 191 aa27.14■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 TTLL5Q6EMB2 1281 aa27.14■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 GTF3C6Q969F1 213 aa27.14■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.13■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 FOXP2O15409 715 aa27.13■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 NTSR2O95665 410 aa27.13■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 VPS72Q15906 364 aa27.13■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 CCDC102BQ68D86 513 aa27.13■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 BRF1Q92994 677 aa27.13■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 SEC31BQ9NQW1 1179 aa27.13■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 PDCP20941 246 aa27.12■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 FGFR2P21802 821 aa27.12■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 PHKA1P46020 1223 aa27.12■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 LPIN2Q92539 896 aa27.12■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 MYH7P12883 1935 aa27.12■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 FGD1P98174 961 aa27.12■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP27.12■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 LINC00116Q8NCU8 138 aa27.11■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 SYCE3A1L190 88 aa27.1■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 CDC37L1Q7L3B6 337 aa27.1■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 MPHOSPH8Q99549 860 aa27.1■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 CCDC152Q4G0S7 254 aa27.1■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 CTNNA3Q9UI47 895 aa27.1■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 FIBPO43427 364 aa27.09■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 NASPP49321 788 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa27.09■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 ADD2P35612 726 aa27.09■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 AGXT2Q9BYV1 514 aa27.09■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 ZNF652Q9Y2D9 606 aa27.09■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 ARAP2Q8WZ64 1704 aa27.08■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 ZNF831Q5JPB2 1677 aa27.08■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 GPAA1O43292 621 aa27.08■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 JAK2O60674 1132 aa27.08■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 FGAP02671 866 aa27.08■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 KCNQ4P56696 695 aa27.08■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa27.08■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa27.08■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 LRSAM1Q6UWE0 723 aa27.08■■□□□ 1.93
SNX18-201ENST00000326277 BCORQ6W2J9 1755 aa27.07■■□□□ 1.92
SNX18-201ENST00000326277 SCRN1Q12765 414 aa27.07■■□□□ 1.92
SNX18-201ENST00000326277 RTL9Q8NET4 1388 aa27.07■■□□□ 1.92
SNX18-201ENST00000326277 SNAP23O00161 211 aa27.07■■□□□ 1.92
SNX18-201ENST00000326277 SLC5A1P13866 664 aa27.07■■□□□ 1.92
SNX18-201ENST00000326277 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
SNX18-201ENST00000326277 PTF1AQ7RTS3 328 aa27.07■■□□□ 1.92
SNX18-201ENST00000326277 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
SNX18-201ENST00000326277 RBSNQ9H1K0 784 aa27.07■■□□□ 1.92
SNX18-201ENST00000326277 LAMB2P55268 1798 aa27.06■■□□□ 1.92
SNX18-201ENST00000326277 PFKFB2O60825 505 aa27.06■■□□□ 1.92
SNX18-201ENST00000326277 IDH1O75874 414 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
SNX18-201ENST00000326277 HAND2P61296 217 aa27.06■■□□□ 1.92
SNX18-201ENST00000326277 APOBRQ0VD83 1088 aa27.06■■□□□ 1.92
SNX18-201ENST00000326277 FERMT3Q86UX7 667 aa27.06■■□□□ 1.92
SNX18-201ENST00000326277 UBE2HP62256 183 aa27.05■■□□□ 1.92
SNX18-201ENST00000326277 CLEC4GQ6UXB4 293 aa27.05■■□□□ 1.92
SNX18-201ENST00000326277 CHST3Q7LGC8 479 aa27.05■■□□□ 1.92
SNX18-201ENST00000326277 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
SNX18-201ENST00000326277 ATRNO75882 1429 aa27.04■■□□□ 1.92
SNX18-201ENST00000326277 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
SNX18-201ENST00000326277 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
SNX18-201ENST00000326277 UBE3CQ15386 1083 aa27.04■■□□□ 1.92
SNX18-201ENST00000326277 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa27.04■■□□□ 1.92
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