RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 ANO10Q9NW15 660 aa29.58■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa29.58■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 PCDHA7Q9UN72 937 aa29.58■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 NEMFO60524 1076 aa29.57■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 ST7Q9NRC1 585 aa29.57■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 GCP02774 474 aa29.56■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 ZNF790Q6PG37 636 aa29.56■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 GOLIM4O00461 696 aa29.56■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 DPCR1Q3MIW9 517 aa29.56■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.55■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 CEP57L1Q8IYX8 460 aa29.55■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 KCNH5Q8NCM2 988 aa29.55■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 SALL1Q9NSC2 1324 aa29.55■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 FDPSP14324 419 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 NDUFA8P51970 172 aa29.55■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 ARHGEF25Q86VW2 580 aa29.55■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 LAMA4Q16363 1823 aa29.55■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 MYH15Q9Y2K3 1946 aa29.54■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 TTLL5Q6EMB2 1281 aa29.54■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 KBTBD3Q8NAB2 608 aa29.54■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 BIN1O00499 593 aa29.53■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 SDF4Q9BRK5 362 aa29.53■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 GJB4Q9NTQ9 266 aa29.53■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 E7EWF7 191 aa29.53■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 ARMCX5Q6P1M9 558 aa29.53■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa29.53■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 CLIC4Q9Y696 253 aa29.53■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa29.52■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 ZNF446Q9NWS9 450 aa29.52■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 FMNL2Q96PY5 1086 aa29.52■■■□□ 2.32
SENP3-201ENST00000321337 LRP10Q7Z4F1 713 aa29.51■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 ERO1AQ96HE7 468 aa29.51■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 NEUROD6Q96NK8 337 aa29.51■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 NEDD4P46934 1319 aa29.51■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 C5P01031 1676 aa29.51■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 TIMM10P62072 90 aa29.51■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa29.51■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 IFNKQ9P0W0 207 aa29.51■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 CARMIL3Q8ND23 1372 aa29.51■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 TMC6Q7Z403 805 aa29.5■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 AGXT2Q9BYV1 514 aa29.5■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 SMC2O95347 1197 aa29.5■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 SLU7O95391 586 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 SH3TC1Q8TE82 1336 aa29.5■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 KRT222Q8N1A0 295 aa29.49■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 A0A087WZG4 1122 aa29.49■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 ISM2Q6H9L7 571 aa29.49■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa29.49■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 TERF2Q15554 542 aa29.48■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa29.48■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 SYT10Q6XYQ8 523 aa29.48■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa29.48■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 LMBR1LQ6UX01 489 aa29.48■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 PAG1Q9NWQ8 432 aa29.47■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 ORAI2Q96SN7 254 aa29.47■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 FAM53CQ9NYF3 392 aa29.47■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 KIAA1468Q9P260 1216 aa29.47■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 RFX7Q2KHR2 1363 aa29.46■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 LINC00301Q8NCQ3 95 aa29.46■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 ADALQ6DHV7 355 aa29.46■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 RTEL1Q9NZ71 1219 aa29.46■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 SLC52A2Q9HAB3 445 aa29.45■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 MAST3O60307 1309 aa29.45■■■□□ 2.31
SENP3-201ENST00000321337 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.3
SENP3-201ENST00000321337 KCND1Q9NSA2 647 aa29.45■■■□□ 2.3
SENP3-201ENST00000321337 GSDMDP57764 484 aa29.44■■■□□ 2.3
SENP3-201ENST00000321337 PTPN21Q16825 1174 aa29.44■■■□□ 2.3
SENP3-201ENST00000321337 DSCC1Q9BVC3 393 aa29.44■■■□□ 2.3
SENP3-201ENST00000321337 ABCC6O95255 1503 aa29.44■■■□□ 2.3
SENP3-201ENST00000321337 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
SENP3-201ENST00000321337 M0R2C6 588 aa29.44■■■□□ 2.3
SENP3-201ENST00000321337 HAND2P61296 217 aa29.44■■■□□ 2.3
SENP3-201ENST00000321337 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa29.44■■■□□ 2.3
SENP3-201ENST00000321337 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
SENP3-201ENST00000321337 STK38Q15208 465 aa29.43■■■□□ 2.3
SENP3-201ENST00000321337 ATG9AQ7Z3C6 839 aa29.43■■■□□ 2.3
SENP3-201ENST00000321337 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.43■■■□□ 2.3
SENP3-201ENST00000321337 CASP7P55210 303 aa29.43■■■□□ 2.3
SENP3-201ENST00000321337 NCAPHQ15003 741 aa29.43■■■□□ 2.3
SENP3-201ENST00000321337 PALLDQ8WX93 1383 aa29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.8 ms