RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314583.7

HCLS1-201, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCLS1, Length 2,000 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-201ENST00000314583 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.03■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 LAMA4Q16363 1823 aa22.02■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 LARGE1O95461 756 aa22.02■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 NEK1Q96PY6 1258 aa22.02■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 FAM177BA6PVY3 158 aa22.02■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 PDE8BO95263 885 aa22.02■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.02■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 NARFQ9UHQ1 456 aa22.02■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 MAST3O60307 1309 aa22.02■■□□□ 1.12
HCLS1-201ENST00000314583 CASZ1Q86V15 1759 aa22.02■■□□□ 1.12
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HCLS1-201ENST00000314583 C4AP0C0L4 1744 aa22.01■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 CHGBP05060 677 aa22.01■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 ME3Q16798 604 aa22.01■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.01■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 CYP21A2P08686 494 aa22■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC152Q4G0S7 254 aa22■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.115e-6■■■■■ 34.6
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HCLS1-201ENST00000314583 GNPATO15228 680 aa21.99■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 STX6O43752 255 aa21.99■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa21.99■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa21.99■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 SMIM5Q71RC9 77 aa21.99■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 LPIN2Q92539 896 aa21.99■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
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HCLS1-201ENST00000314583 ZAP70P43403 619 aa21.98■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 MRE11P49959 708 aa21.98■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 APPBP2Q92624 585 aa21.98■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 MBD3O95983 291 aa21.97■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 GJB2P29033 226 aa21.97■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 SCARF1Q14162 830 aa21.97■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.97■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa21.97■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 M0R2C6 588 aa21.97■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 SYT1P21579 422 aa21.97■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 FGFR2P21802 821 aa21.97■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 ST3GAL1Q11201 340 aa21.97■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.97■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.97■■□□□ 1.11
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HCLS1-201ENST00000314583 SLC5A1P13866 664 aa21.96■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 MCAMP43121 646 aa21.96■■□□□ 1.11
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HCLS1-201ENST00000314583 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.96■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 COL4A1P02462 1669 aa21.96■■□□□ 1.11
HCLS1-201ENST00000314583 ERFEQ4G0M1 354 aa21.96■■□□□ 1.11
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HCLS1-201ENST00000314583 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.95■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 DOCK2Q92608 1830 aa21.95■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 A0A1B0GUL6 1792 aa21.94■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 WASHC4Q2M389 1173 aa21.94■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 SLFNL1Q499Z3 407 aa21.94■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 FAM196AQ6ZSG2 479 aa21.94■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 F13A1P00488 732 aa21.94■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 PDCP20941 246 aa21.94■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC102BQ68D86 513 aa21.94■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 KRT27Q7Z3Y8 459 aa21.93■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 NECAB1Q8N987 351 aa21.93■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 TMEM87AQ8NBN3 555 aa21.93■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 TCEANC2Q96MN5 208 aa21.93■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.93■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.93■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 ZPR1O75312 459 aa21.92■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 Q6ZUG5 572 aa21.92■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 STOX1Q6ZVD7 989 aa21.92■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF445P59923 1031 aa21.92■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.92■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 GRPEL1Q9HAV7 217 aa21.92■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 TCHHQ07283 1943 aa21.91■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 ADD2P35612 726 aa21.91■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 UBE3CQ15386 1083 aa21.91■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 GPT2Q8TD30 523 aa21.91■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 NYXQ9GZU5 481 aa21.91■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 E7EWF7 191 aa21.9■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 PHKA1P46020 1223 aa21.9■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 PI16Q6UXB8 463 aa21.9■■□□□ 1.1
HCLS1-201ENST00000314583 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.9■■□□□ 1.1
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