RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 DNAJC10Q8IXB1 793 aa23.04■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 FAM200AQ8TCP9 573 aa23.04■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 PIGBQ92521 554 aa23.04■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 LRRC2Q9BYS8 371 aa23.04■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.289e-11■□□□□ 10.8
SPNS1-201ENST00000311008 LAMA4Q16363 1823 aa23.04■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 TPM3P06753 285 aa23.03■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 DACT1Q9NYF0 836 aa23.03■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 M0R2C6 588 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 OSBP2Q969R2 916 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 DDX11Q96FC9 970 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 CLSTN2Q9H4D0 955 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 APOBRQ0VD83 1088 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 FAM89AQ96GI7 184 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 PTPDC1A2A3K4 754 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 EVCP57679 992 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 SLFNL1Q499Z3 407 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 APPBP2Q92624 585 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 TYRO3Q06418 890 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 BICD2Q8TD16 824 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 NHSL1Q5SYE7 1610 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 STRCQ7RTU9 1775 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 CTDNEP1O95476 244 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 CAVIN2O95810 425 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 ADORA1P30542 326 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 WASHC4Q2M389 1173 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 PGBD1Q96JS3 809 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 ATP2B3Q16720 1220 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 NLRP10Q86W26 655 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 CAMK4Q16566 473 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 METTL24Q5JXM2 366 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 CTAGE5O15320 804 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 ZAP70P43403 619 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 CTSWP56202 376 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 ITGA6P23229 1130 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 PLCB2Q00722 1185 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 BTG4Q9NY30 223 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 BCL9O00512 1426 aa22.95■■□□□ 1.27
SPNS1-201ENST00000311008 LRP6O75581 1613 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 NR1I2O75469 434 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 FGAP02671 866 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 DISP2A7MBM2 1401 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 NCOA7Q8NI08 942 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 A0A0G2JLW4 131 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 SCARF1Q14162 830 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 CKAP2LQ8IYA6 745 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.93■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 FOXP2O15409 715 aa22.93■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 HLFQ16534 295 aa22.93■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 RGS22Q8NE09 1264 aa22.93■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.93■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 ITGB4P16144 1822 aa22.93■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF213O14771 459 aa22.93■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 ANO6Q4KMQ2 910 aa22.93■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 GREM2Q9H772 168 aa22.93■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 PDE8AO60658 829 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 AK7Q96M32 723 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 GPAA1O43292 621 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 PRC1O43663 620 aa22.92■■□□□ 1.26
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