RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299339.2

CLDN10-201, Transcript of claudin 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN10, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10-201ENST00000299339 NBPF15Q8N660 670 aa8.79□□□□□ -1
CLDN10-201ENST00000299339 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.79□□□□□ -1
CLDN10-201ENST00000299339 CENPFP49454 3210 aa8.79□□□□□ -1
CLDN10-201ENST00000299339 ZNF541Q9H0D2 1346 aa8.79□□□□□ -1
CLDN10-201ENST00000299339 BRCA2P51587 3418 aa8.78□□□□□ -1
CLDN10-201ENST00000299339 FLT4P35916 1363 aa8.78□□□□□ -1
CLDN10-201ENST00000299339 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
CLDN10-201ENST00000299339 WNT7AO00755 349 aa8.78□□□□□ -1
CLDN10-201ENST00000299339 SERPINB2P05120 415 aa8.78□□□□□ -1
CLDN10-201ENST00000299339 MSS51Q4VC12 460 aa8.78□□□□□ -1
CLDN10-201ENST00000299339 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
CLDN10-201ENST00000299339 PARP9Q8IXQ6 854 aa8.78□□□□□ -1
CLDN10-201ENST00000299339 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP8.78□□□□□ -1
CLDN10-201ENST00000299339 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
CLDN10-201ENST00000299339 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa8.78□□□□□ -1
CLDN10-201ENST00000299339 RNF123Q5XPI4 1314 aa8.78□□□□□ -1
CLDN10-201ENST00000299339 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa8.77□□□□□ -1
CLDN10-201ENST00000299339 DLL1O00548 723 aa8.77□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP8.77□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 USP46P62068 366 aa8.77□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 PDE4DQ08499 809 aa8.77□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 GRIPAP1Q4V328 841 aa8.77□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 CDCA8Q53HL2 280 aa8.77□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 CST9Q5W186 159 aa8.77□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 KIF20BQ96Q89 1820 aa8.76□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa8.76□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 ERVV-2B6SEH9 535 aa8.76□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 CIAPIN1Q6FI81 312 aa8.76□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.76□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 HTTP42858 3142 aa8.76□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 KIF24Q5T7B8 1368 aa8.75□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 KDM4AO75164 1064 aa8.75□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 SAPCD2Q86UD0 394 aa8.75□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 TRIM47Q96LD4 638 aa8.75□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 NARFQ9UHQ1 456 aa8.75□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 BCORQ6W2J9 1755 aa8.75□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 SCN11AQ9UI33 1791 aa8.75□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 AKAP11Q9UKA4 1901 aa8.74□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 TRAF5O00463 557 aa8.74□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 TERTO14746 1132 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 PDE6BP35913 854 aa8.74□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 SOGA3Q5TF21 947 aa8.74□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 COL15A1P39059 1388 aa8.73□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 J3QL48 77 aa8.73□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 TRIM32Q13049 653 aa8.73□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 RALBP1Q15311 655 aa8.73□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 HHIPL1Q96JK4 782 aa8.73□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 MRGPRX2Q96LB1 330 aa8.73□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 BRIP1Q9BX63 1249 aa8.73□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 GGNBP2Q9H3C7 697 aa8.73□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 UNC80Q8N2C7 3258 aa8.72□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 MMP16P51512 607 aa8.72□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 BICDL1Q6ZP65 573 aa8.72□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 GPC2Q8N158 579 aa8.72□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 CNKSR1Q969H4 720 aa8.72□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 TESK2Q96S53 571 aa8.72□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 ZIC5Q96T25 663 aa8.72□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 SCN7AQ01118 1682 aa8.72□□□□□ -1.01
CLDN10-201ENST00000299339 FZD9O00144 591 aa8.71□□□□□ -1.02
CLDN10-201ENST00000299339 FYB1O15117 783 aa8.71□□□□□ -1.02
CLDN10-201ENST00000299339 CABP4P57796 275 aa8.71□□□□□ -1.02
CLDN10-201ENST00000299339 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.02
CLDN10-201ENST00000299339 NOGQ13253 232 aa8.71□□□□□ -1.02
CLDN10-201ENST00000299339 TPRNQ4KMQ1 711 aa8.71□□□□□ -1.02
CLDN10-201ENST00000299339 CCDC93Q567U6 631 aa8.71□□□□□ -1.02
CLDN10-201ENST00000299339 STYK1Q6J9G0 422 aa8.71□□□□□ -1.02
CLDN10-201ENST00000299339 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
CLDN10-201ENST00000299339 CCDC24Q8N4L8 307 aa8.71□□□□□ -1.02
CLDN10-201ENST00000299339 SENP2Q9HC62 589 aa8.71□□□□□ -1.02
CLDN10-201ENST00000299339 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CLDN10-201ENST00000299339 SAGE1Q9NXZ1 904 aa8.71□□□□□ -1.02
CLDN10-201ENST00000299339 CELF2O95319 508 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CLDN10-201ENST00000299339 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CLDN10-201ENST00000299339 DIXDC1Q155Q3 683 aa8.7□□□□□ -1.02
CLDN10-201ENST00000299339 PRR5LQ6MZQ0 368 aa8.7□□□□□ -1.02
CLDN10-201ENST00000299339 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.7□□□□□ -1.02
CLDN10-201ENST00000299339 DNAJC10Q8IXB1 793 aa8.7□□□□□ -1.02
CLDN10-201ENST00000299339 HPS1Q92902 700 aa8.7□□□□□ -1.02
CLDN10-201ENST00000299339 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.7□□□□□ -1.02
CLDN10-201ENST00000299339 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa8.7□□□□□ -1.02
CLDN10-201ENST00000299339 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CLDN10-201ENST00000299339 HOXA2O43364 376 aa8.69□□□□□ -1.02
CLDN10-201ENST00000299339 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CLDN10-201ENST00000299339 SRGNP10124 158 aa8.69□□□□□ -1.02
CLDN10-201ENST00000299339 MS4A1P11836 297 aa8.69□□□□□ -1.02
CLDN10-201ENST00000299339 EPS15P42566 896 aa8.69□□□□□ -1.02
CLDN10-201ENST00000299339 Q3C1V9 767 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms