RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299084.8

SPRED1-201, Transcript of sprouty related EVH1 domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPRED1, Length 7,780 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED1-201ENST00000299084 DIXDC1Q155Q3 683 aa16.18■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 EYA3Q99504 573 aa16.18■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 STIM2Q9P246 746 aa16.18■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa16.18■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 FSIP1Q8NA03 581 aa16.18■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 HOOK2Q96ED9 719 aa16.18■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 HARSP12081 509 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 PLCG2P16885 1265 aa16.17■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 KRT9P35527 623 aa16.17■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 PPP2R5DQ14738 602 aa16.17■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 CSRNP2Q9H175 543 aa16.17■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 CLUL1Q15846 466 aa16.17■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 CCDC183Q5T5S1 534 aa16.17■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 RSPH14Q9UHP6 348 aa16.17■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 GSDMDP57764 484 aa16.17■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 FERMT3Q86UX7 667 aa16.17■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 USP25Q9UHP3 1055 aa16.17■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 SMTNP53814 917 aa16.17■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 STRN3Q13033 797 aa16.17■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 CLSTN2Q9H4D0 955 aa16.17■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 ITM2BQ9Y287 266 aa16.17■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 TACC1O75410 805 aa16.16■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 GPR162Q16538 588 aa16.16■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 NCOA7Q8NI08 942 aa16.16■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 IFT74Q96LB3 600 aa16.16■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 ANO3Q9BYT9 981 aa16.16■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 CIB2O75838 187 aa16.16■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 FMNL3Q8IVF7 1028 aa16.16■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 CTAGE1Q96RT6 745 aa16.16■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 ZBTB3Q9H5J0 574 aa16.16■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa16.16■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 DUSP27Q5VZP5 1158 aa16.16■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 CEP128Q6ZU80 1094 aa16.16■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 MIS18AQ9NYP9 233 aa16.16■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP16.16■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 N4BP3O15049 544 aa16.16■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 CCDC170Q8IYT3 715 aa16.16■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 TTLL3Q9Y4R7 772 aa16.16■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 CDR2Q01850 454 aa16.16■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 ACSBG1Q96GR2 724 aa16.16■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 CARD10Q9BWT7 1032 aa16.16■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 IGF1RP08069 1367 aa16.16■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 PDE6AP16499 860 aa16.16■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 PRR16Q569H4 304 aa16.16■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 TMC6Q7Z403 805 aa16.16■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 MICALL1Q8N3F8 863 aa16.16■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 ADAMTS8Q9UP79 889 aa16.16■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 FGD6Q6ZV73 1430 aa16.16■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 SLC52A1Q9NWF4 448 aa16.15■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 STX1AQ16623 288 aa16.15■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 USP16Q9Y5T5 823 aa16.15■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 CYP7A1P22680 504 aa16.15■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 SETDB1Q15047 1291 aa16.15■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 SMIM23A6NLE4 172 aa16.15■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa16.15■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 PSMD6Q15008 389 aa16.15■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 C4orf50Q6ZRC1 276 aa16.15■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 CCDC25Q86WR0 208 aa16.15■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 TMTC2Q8N394 836 aa16.15■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 PANK2Q9BZ23 570 aa16.15■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa16.15■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.15■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 ABL1P00519 1130 aa16.15■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 BIRC3Q13489 604 aa16.15■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa16.15■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 MGEA5O60502 916 aa16.15■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 BMP15O95972 392 aa16.15■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 KIF11P52732 1056 aa16.14■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 ESR2Q92731 530 aa16.14■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.18
SPRED1-201ENST00000299084 GOLGA6CA6NDK9 693 aa16.14■□□□□ 0.17
SPRED1-201ENST00000299084 GOLGA6BA6NDN3 693 aa16.14■□□□□ 0.17
SPRED1-201ENST00000299084 GOLGA6DP0CG33 693 aa16.14■□□□□ 0.17
SPRED1-201ENST00000299084 ATXN8OSP0DMR3 200 aa16.14■□□□□ 0.17
SPRED1-201ENST00000299084 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa16.14■□□□□ 0.17
SPRED1-201ENST00000299084 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
SPRED1-201ENST00000299084 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa16.14■□□□□ 0.17
SPRED1-201ENST00000299084 SYNJ1O43426 1573 aa16.14■□□□□ 0.17
SPRED1-201ENST00000299084 CCDC121Q6ZUS5 278 aa16.14■□□□□ 0.17
SPRED1-201ENST00000299084 ISM2Q6H9L7 571 aa16.14■□□□□ 0.17
SPRED1-201ENST00000299084 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
SPRED1-201ENST00000299084 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.14■□□□□ 0.17
SPRED1-201ENST00000299084 BANK1Q8NDB2 785 aa16.14■□□□□ 0.17
SPRED1-201ENST00000299084 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
SPRED1-201ENST00000299084 BIN1O00499 593 aa16.13■□□□□ 0.17
SPRED1-201ENST00000299084 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SPRED1-201ENST00000299084 PPP4R4Q6NUP7 873 aa16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms