RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296839.4

FOXQ1-201, Transcript of forkhead box Q1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene FOXQ1, Length 2,309 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1-201ENST00000296839 KRT32Q14532 448 aa31.26■■■□□ 2.6
FOXQ1-201ENST00000296839 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa31.26■■■□□ 2.6
FOXQ1-201ENST00000296839 C4BP0C0L5 1744 aa31.26■■■□□ 2.6
FOXQ1-201ENST00000296839 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 COL4A1P02462 1669 aa31.25■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 CCDC102BQ68D86 513 aa31.25■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 M0R2C6 588 aa31.25■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 RPS6KB1P23443 525 aa31.25■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 BICDL1Q6ZP65 573 aa31.25■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 SLC5A1P13866 664 aa31.24■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 PTMSP20962 102 aa31.24■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 PHKA1P46020 1223 aa31.24■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 OSBP2Q969R2 916 aa31.24■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 LARGE1O95461 756 aa31.24■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 C4AP0C0L4 1744 aa31.23■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 CYP21A2P08686 494 aa31.23■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa31.23■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 ZPR1O75312 459 aa31.23■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 A0A1B0GUL6 1792 aa31.22■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 C3orf67Q6ZVT6 689 aa31.22■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 LAMA4Q16363 1823 aa31.22■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 SLC10A5Q5PT55 438 aa31.21■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 AMIGO3Q86WK7 504 aa31.21■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 BRD1O95696 1058 aa31.21■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 GOLGA6L22H0YM25 854 aa31.2■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 APPBP2Q92624 585 aa31.2■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 TAF1P21675 1872 aa31.2■■■□□ 2.59
FOXQ1-201ENST00000296839 WASHC4Q2M389 1173 aa31.2■■■□□ 2.58
FOXQ1-201ENST00000296839 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.58
FOXQ1-201ENST00000296839 SETDB2Q96T68 719 aa31.2■■■□□ 2.58
FOXQ1-201ENST00000296839 NYXQ9GZU5 481 aa31.2■■■□□ 2.58
FOXQ1-201ENST00000296839 NEK1Q96PY6 1258 aa31.19■■■□□ 2.58
FOXQ1-201ENST00000296839 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP31.19■■■□□ 2.58
FOXQ1-201ENST00000296839 ANKRD1Q15327 319 aa31.19■■■□□ 2.58
FOXQ1-201ENST00000296839 BRWD3Q6RI45 1802 aa31.18■■■□□ 2.58
FOXQ1-201ENST00000296839 SNAP23O00161 211 aa31.18■■■□□ 2.58
FOXQ1-201ENST00000296839 ME3Q16798 604 aa31.18■■■□□ 2.58
FOXQ1-201ENST00000296839 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
FOXQ1-201ENST00000296839 CHRNDQ07001 517 aa31.18■■■□□ 2.58
FOXQ1-201ENST00000296839 TPCN1Q9ULQ1 816 aa31.18■■■□□ 2.58
FOXQ1-201ENST00000296839 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa31.17■■■□□ 2.58
FOXQ1-201ENST00000296839 TCEANC2Q96MN5 208 aa31.17■■■□□ 2.58
FOXQ1-201ENST00000296839 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
FOXQ1-201ENST00000296839 DOCK2Q92608 1830 aa31.16■■■□□ 2.58
FOXQ1-201ENST00000296839 ADD2P35612 726 aa31.16■■■□□ 2.58
FOXQ1-201ENST00000296839 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
FOXQ1-201ENST00000296839 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa31.16■■■□□ 2.58
FOXQ1-201ENST00000296839 CCDC83Q8IWF9 413 aa31.16■■■□□ 2.58
FOXQ1-201ENST00000296839 ST3GAL1Q11201 340 aa31.15■■■□□ 2.58
FOXQ1-201ENST00000296839 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
FOXQ1-201ENST00000296839 MCTP1Q6DN14 999 aa31.15■■■□□ 2.58
FOXQ1-201ENST00000296839 STOX1Q6ZVD7 989 aa31.15■■■□□ 2.58
FOXQ1-201ENST00000296839 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
FOXQ1-201ENST00000296839 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
FOXQ1-201ENST00000296839 SMC3Q9UQE7 1217 aa31.14■■■□□ 2.58
FOXQ1-201ENST00000296839 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
FOXQ1-201ENST00000296839 SPATA5Q8NB90 893 aa31.13■■■□□ 2.57
FOXQ1-201ENST00000296839 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
FOXQ1-201ENST00000296839 LRRC4BQ9NT99 713 aa31.13■■■□□ 2.57
FOXQ1-201ENST00000296839 FOXP2O15409 715 aa31.13■■■□□ 2.57
FOXQ1-201ENST00000296839 TRAPPC3LQ5T215 181 aa31.13■■■□□ 2.57
FOXQ1-201ENST00000296839 FAM196AQ6ZSG2 479 aa31.13■■■□□ 2.57
FOXQ1-201ENST00000296839 RASGRF1Q13972 1273 aa31.12■■■□□ 2.57
FOXQ1-201ENST00000296839 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa31.12■■■□□ 2.57
FOXQ1-201ENST00000296839 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
FOXQ1-201ENST00000296839 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
FOXQ1-201ENST00000296839 A0A0G2JLW4 131 aa31.11■■■□□ 2.57
FOXQ1-201ENST00000296839 IDH1O75874 414 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
FOXQ1-201ENST00000296839 RFC4P35249 363 aa31.11■■■□□ 2.57
FOXQ1-201ENST00000296839 UBE3CQ15386 1083 aa31.11■■■□□ 2.57
FOXQ1-201ENST00000296839 TPTE2Q6XPS3 522 aa31.11■■■□□ 2.57
FOXQ1-201ENST00000296839 UBR3Q6ZT12 1888 aa31.11■■■□□ 2.57
FOXQ1-201ENST00000296839 PHF14O94880 888 aa31.1■■■□□ 2.57
FOXQ1-201ENST00000296839 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
FOXQ1-201ENST00000296839 NECAB1Q8N987 351 aa31.1■■■□□ 2.57
FOXQ1-201ENST00000296839 GPAA1O43292 621 aa31.1■■■□□ 2.57
FOXQ1-201ENST00000296839 NLRP3Q96P20 1036 aa31.1■■■□□ 2.57
FOXQ1-201ENST00000296839 CTNNA3Q9UI47 895 aa31.1■■■□□ 2.57
FOXQ1-201ENST00000296839 BCAMP50895 628 aa31.09■■■□□ 2.57
FOXQ1-201ENST00000296839 TTLL5Q6EMB2 1281 aa31.09■■■□□ 2.57
FOXQ1-201ENST00000296839 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP31.09■■■□□ 2.57
FOXQ1-201ENST00000296839 PDE6AP16499 860 aa31.08■■■□□ 2.57
FOXQ1-201ENST00000296839 KRT27Q7Z3Y8 459 aa31.08■■■□□ 2.57
FOXQ1-201ENST00000296839 E7EWF7 191 aa31.08■■■□□ 2.57
FOXQ1-201ENST00000296839 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
FOXQ1-201ENST00000296839 WWC3Q9ULE0 1092 aa31.08■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms