RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.06■■□□□ 1.6
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CXCL3-201ENST00000296026 CASP7P55210 303 aa25.05■■□□□ 1.6
CXCL3-201ENST00000296026 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
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CXCL3-201ENST00000296026 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
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CXCL3-201ENST00000296026 ABHD8Q96I13 439 aa25.03■■□□□ 1.6
CXCL3-201ENST00000296026 LEMD3Q9Y2U8 911 aa25.03■■□□□ 1.6
CXCL3-201ENST00000296026 CSF1RP07333 972 aa25.02■■□□□ 1.6
CXCL3-201ENST00000296026 CDCA5Q96FF9 252 aa25.02■■□□□ 1.6
CXCL3-201ENST00000296026 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.02■■□□□ 1.6
CXCL3-201ENST00000296026 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
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CXCL3-201ENST00000296026 ANKRD2Q9GZV1 360 aa25.01■■□□□ 1.59
CXCL3-201ENST00000296026 COA1Q9GZY4 146 aa25.01■■□□□ 1.59
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
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CXCL3-201ENST00000296026 STRIP1Q5VSL9 837 aa24.98■■□□□ 1.59
CXCL3-201ENST00000296026 MYO3BQ8WXR4 1341 aa24.97■■□□□ 1.59
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CXCL3-201ENST00000296026 OGFOD1Q8N543 542 aa24.97■■□□□ 1.59
CXCL3-201ENST00000296026 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
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CXCL3-201ENST00000296026 NBPF9Q3BBW0 867 aa24.96■■□□□ 1.59
CXCL3-201ENST00000296026 BEND3Q5T5X7 828 aa24.96■■□□□ 1.59
CXCL3-201ENST00000296026 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.96■■□□□ 1.59
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CXCL3-201ENST00000296026 SLC10A3P09131 477 aa24.94■■□□□ 1.58
CXCL3-201ENST00000296026 CHMP3Q9Y3E7 222 aa24.94■■□□□ 1.58
CXCL3-201ENST00000296026 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa24.94■■□□□ 1.58
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CXCL3-201ENST00000296026 FKBP1BP68106 108 aa24.93■■□□□ 1.58
CXCL3-201ENST00000296026 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
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CXCL3-201ENST00000296026 RASAL3Q86YV0 1011 aa24.9■■□□□ 1.58
CXCL3-201ENST00000296026 KIAA0825Q8IV33 1275 aa24.9■■□□□ 1.58
CXCL3-201ENST00000296026 MCOLN1Q9GZU1 580 aa24.9■■□□□ 1.58
CXCL3-201ENST00000296026 CD209Q9NNX6 404 aa24.9■■□□□ 1.58
CXCL3-201ENST00000296026 SAGE1Q9NXZ1 904 aa24.9■■□□□ 1.58
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CXCL3-201ENST00000296026 EPHA10Q5JZY3 1008 aa24.89■■□□□ 1.58
CXCL3-201ENST00000296026 MOB2Q70IA6 237 aa24.89■■□□□ 1.58
CXCL3-201ENST00000296026 CSRNP1Q96S65 589 aa24.89■■□□□ 1.58
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CXCL3-201ENST00000296026 IRS2Q9Y4H2 1338 aa24.88■■□□□ 1.57
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CXCL3-201ENST00000296026 CCDC57Q2TAC2 916 aa24.87■■□□□ 1.57
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CXCL3-201ENST00000296026 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
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CXCL3-201ENST00000296026 ALDH1L1O75891 902 aa24.86■■□□□ 1.57
CXCL3-201ENST00000296026 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CXCL3-201ENST00000296026 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.86■■□□□ 1.57
CXCL3-201ENST00000296026 NF2P35240 595 aa24.85■■□□□ 1.57
CXCL3-201ENST00000296026 TAF7LQ5H9L4 462 aa24.85■■□□□ 1.57
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CXCL3-201ENST00000296026 ZNF804AQ7Z570 1209 aa24.85■■□□□ 1.57
CXCL3-201ENST00000296026 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CXCL3-201ENST00000296026 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CXCL3-201ENST00000296026 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.85■■□□□ 1.57
CXCL3-201ENST00000296026 PLIN1O60240 522 aa24.84■■□□□ 1.57
CXCL3-201ENST00000296026 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CXCL3-201ENST00000296026 CERS5Q8N5B7 392 aa24.84■■□□□ 1.57
CXCL3-201ENST00000296026 IL1R1P14778 569 aa24.83■■□□□ 1.57
CXCL3-201ENST00000296026 CNNM1Q9NRU3 951 aa24.83■■□□□ 1.57
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF521Q96K83 1311 aa24.83■■□□□ 1.56
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