RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 CCDC191Q8NCU4 936 aa16.69■□□□□ 0.26
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PTPRN-201ENST00000295718 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP16.63■□□□□ 0.25
PTPRN-201ENST00000295718 FANCLQ9NW38 375 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRN-201ENST00000295718 ERLIN1O75477 346 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRN-201ENST00000295718 ADGRB3O60242 1522 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRN-201ENST00000295718 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
PTPRN-201ENST00000295718 PFKFB1P16118 471 aa16.62■□□□□ 0.25
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