RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271526.8

PRCC-201, Transcript of proline rich mitotic checkpoint control factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRCC, Length 2,105 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCC-201ENST00000271526 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 SKILP12757 684 aa20.38■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 PTPN14Q15678 1187 aa20.38■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 SLFNL1Q499Z3 407 aa20.38■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 KLHDC4Q8TBB5 520 aa20.38■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 AGXT2Q9BYV1 514 aa20.38■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 FAM53CQ9NYF3 392 aa20.38■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 FAM160A1Q05DH4 1040 aa20.37■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 ARID5BQ14865 1188 aa20.37■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 SALL1Q9NSC2 1324 aa20.37■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 LAMB4A4D0S4 1761 aa20.37■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.37■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 CCDC69A6NI79 296 aa20.36■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa20.36■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.36■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.36■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 CTDNEP1O95476 244 aa20.36■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa20.36■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 ERO1AQ96HE7 468 aa20.36■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 GSDMDP57764 484 aa20.35■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.35■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 HAUS7Q99871 368 aa20.35■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 BECN2A8MW95 431 aa20.35■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 KINO60870 393 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 STOX1Q6ZVD7 989 aa20.35■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 CEP57L1Q8IYX8 460 aa20.35■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 USP28Q96RU2 1077 aa20.35■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 IMPACTQ9P2X3 320 aa20.35■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 TNS3Q68CZ2 1445 aa20.34■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 H7C1W4 665 aa20.34■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 TFCP2Q12800 502 aa20.34■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 GPR108Q9NPR9 543 aa20.34■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 PALLDQ8WX93 1383 aa20.34■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 PTPDC1A2A3K4 754 aa20.33■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 KMT5BQ4FZB7 885 aa20.33■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 TAF3Q5VWG9 929 aa20.33■□□□□ 0.85
PRCC-201ENST00000271526 SLFN14P0C7P3 912 aa20.33■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa20.33■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 ZNF592Q92610 1267 aa20.33■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 ATF3P18847 181 aa20.32■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 KCNJ6P48051 423 aa20.32■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 BPIFA3Q9BQP9 254 aa20.32■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa20.32■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 NBPF11Q86T75 865 aa20.32■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 KRT222Q8N1A0 295 aa20.32■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 A0A087WZG4 1122 aa20.31■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 FOXO4P98177 505 aa20.31■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 DSCC1Q9BVC3 393 aa20.31■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 A0A1W2PQ27 194 aa20.3■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 A0A1W2PQ64 194 aa20.3■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 A0A1W2PQD8 194 aa20.3■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 FSIP1Q8NA03 581 aa20.3■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 KBTBD3Q8NAB2 608 aa20.3■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 L2HGDHQ9H9P8 463 aa20.3■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 SLU7O95391 586 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa20.3■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 AOPEPQ8N6M6 819 aa20.3■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa20.29■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 CABP4P57796 275 aa20.29■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.29■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 DBNDD2Q9BQY9 259 aa20.29■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 LRRC2Q9BYS8 371 aa20.29■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 UBR2Q8IWV8 1755 aa20.29■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 CHGBP05060 677 aa20.29■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 FAM193AP78312 1265 aa20.29■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 ADALQ6DHV7 355 aa20.29■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa20.29■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 FBXL16Q8N461 479 aa20.29■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 HELLSQ9NRZ9 838 aa20.29■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.29■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 NBPF26B4DH59 902 aa20.28■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 FGD1P98174 961 aa20.28■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 APOBRQ0VD83 1088 aa20.28■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 TERF2Q15554 542 aa20.28■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 NBPF14Q5TI25 921 aa20.28■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.28■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 NBPF15Q8N660 670 aa20.28■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 CCDC150Q8NCX0 1101 aa20.28■□□□□ 0.84
PRCC-201ENST00000271526 NEDD4P46934 1319 aa20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms