RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 H7C1W4 665 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 IDH1O75874 414 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 TPM2P07951 284 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 ZNF165P49910 485 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 CCDC57Q2TAC2 916 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 TTC39AQ5SRH9 613 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 GREM2Q9H772 168 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 EYA2O00167 538 aa10.21□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 IGSF3O75054 1194 aa10.21□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 BRINP3Q76B58 766 aa10.21□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP10.21□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 V9GYY5 206 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 FGAP02671 866 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 FDPSP14324 419 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 SPECC1Q5M775 1068 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 PHKBQ93100 1093 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 CEP126Q9P2H0 1117 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 CLIC4Q9Y696 253 aa10.21□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 SPDYE4A6NLX3 237 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 NPHP1O15259 732 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 ADD1P35611 737 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 HS1BP3Q53T59 392 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 USP27XA6NNY8 438 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 RRP9O43818 475 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 USPL1Q5W0Q7 1092 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 SASS6Q6UVJ0 657 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 FAM200AQ8TCP9 573 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 PIBF1Q8WXW3 757 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 PIGBQ92521 554 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 CHMP4AQ9BY43 222 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 HDAC5Q9UQL6 1122 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 ANKRD1Q15327 319 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 NCAPD2Q15021 1401 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 KIF28PB7ZC32 967 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 ATP2B1P20020 1258 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 PDCP20941 246 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 GOLGA8FQ08AF8 430 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 METTL24Q5JXM2 366 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 ZNF710Q8N1W2 664 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 FSIP1Q8NA03 581 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 ACSBG1Q96GR2 724 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 ZMYND15Q9H091 742 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 GOLGA8BA8MQT2 603 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 CCDC24Q8N4L8 307 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 MST1RQ04912 1400 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 MCAMP43121 646 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 MICU3Q86XE3 530 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 SLC4A9Q96Q91 983 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 CLSTN2Q9H4D0 955 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 TOMM22Q9NS69 142 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 HMG20BQ9P0W2 317 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 SLIT3O75094 1523 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 PRC1O43663 620 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 PHKA1P46020 1223 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 CNNM1Q9NRU3 951 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 TMOD3Q9NYL9 352 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 EP400Q96L91 3159 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 ITGA6P23229 1130 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 IL15P40933 162 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 NDUFA8P51970 172 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 ANTXR2P58335 489 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 CBX1P83916 185 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 CLIP2Q9UDT6 1046 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 WWC3Q9ULE0 1092 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 B4E1Z4 1266 aa10.17□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 GPAA1O43292 621 aa10.17□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 PFKFB2O60825 505 aa10.17□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 IL2RBP14784 551 aa10.17□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 CTDSPL2Q05D32 466 aa10.17□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 SLC51AQ86UW1 340 aa10.17□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 AOPEPQ8N6M6 819 aa10.17□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 KIAA1524Q8TCG1 905 aa10.17□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 BTG4Q9NY30 223 aa10.17□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 PCDHA7Q9UN72 937 aa10.17□□□□□ -0.78
GINS1-201ENST00000262460 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.8 ms