RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260116.4

TTPA-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPA, Length 2,338 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPA-201ENST00000260116 DOK7Q18PE1 504 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPA-201ENST00000260116 SP8Q8IXZ3 490 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPA-201ENST00000260116 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
TTPA-201ENST00000260116 KCNQ5Q9NR82 932 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPA-201ENST00000260116 DUOX1Q9NRD9 1551 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPA-201ENST00000260116 ZNF804BA4D1E1 1349 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPA-201ENST00000260116 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
TTPA-201ENST00000260116 XAGE2Q96GT9 111 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPA-201ENST00000260116 DBNDD1Q9H9R9 158 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPA-201ENST00000260116 XDHP47989 1333 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPA-201ENST00000260116 NFKBIEO00221 500 aa13.35□□□□□ -0.27
TTPA-201ENST00000260116 PHKA1P46020 1223 aa13.35□□□□□ -0.27
TTPA-201ENST00000260116 SCARF1Q14162 830 aa13.35□□□□□ -0.27
TTPA-201ENST00000260116 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
TTPA-201ENST00000260116 SNRKQ9NRH2 765 aa13.35□□□□□ -0.27
TTPA-201ENST00000260116 A0A1B0GUL6 1792 aa13.35□□□□□ -0.27
TTPA-201ENST00000260116 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
TTPA-201ENST00000260116 GPR162Q16538 588 aa13.35□□□□□ -0.27
TTPA-201ENST00000260116 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa13.35□□□□□ -0.27
TTPA-201ENST00000260116 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
TTPA-201ENST00000260116 GGA1Q9UJY5 639 aa13.35□□□□□ -0.27
TTPA-201ENST00000260116 ZNF609O15014 1411 aa13.35□□□□□ -0.27
TTPA-201ENST00000260116 RAB11FIP3O75154 756 aa13.34□□□□□ -0.27
TTPA-201ENST00000260116 FGFR2P21802 821 aa13.34□□□□□ -0.27
TTPA-201ENST00000260116 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa13.34□□□□□ -0.27
TTPA-201ENST00000260116 CHGBP05060 677 aa13.34□□□□□ -0.27
TTPA-201ENST00000260116 WASHC4Q2M389 1173 aa13.34□□□□□ -0.27
TTPA-201ENST00000260116 ERC1Q8IUD2 1116 aa13.34□□□□□ -0.27
TTPA-201ENST00000260116 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
TTPA-201ENST00000260116 COL4A5P29400 1685 aa13.33□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 LRRC37AA6NMS7 1700 aa13.33□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 CCDC93Q567U6 631 aa13.33□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 GORABQ5T7V8 394 aa13.33□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 SNED1Q8TER0 1413 aa13.33□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 LPIN2Q92539 896 aa13.33□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 BOLA2Q9H3K6 86 aa13.33□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 CCDC102BQ68D86 513 aa13.33□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 MXD3Q9BW11 206 aa13.33□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 MX1P20591 662 aa13.32□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 VPS37DQ86XT2 251 aa13.32□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa13.32□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 ANKRD2Q9GZV1 360 aa13.32□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 LTBP1Q14766 1721 aa13.32□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 PPIP5K2O43314 1243 aa13.31□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 SLFNL1Q499Z3 407 aa13.31□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa13.31□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 FBXW7Q969H0 707 aa13.31□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 FBXO3Q9UK99 471 aa13.31□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 CHD4Q14839 1912 aa13.31□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 SLC5A1P13866 664 aa13.31□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP13.31□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 TAOK3Q9H2K8 898 aa13.31□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 ANTXR1Q9H6X2 564 aa13.31□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 MCAMP43121 646 aa13.3□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 PDE1AP54750 535 aa13.3□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 RASGRF1Q13972 1273 aa13.3□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 AKAP2Q9Y2D5 859 aa13.3□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 IRS2Q9Y4H2 1338 aa13.3□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 UBE4AQ14139 1066 aa13.3□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 SALL3Q9BXA9 1300 aa13.3□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 LARGE2Q8N3Y3 721 aa13.29□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 ATP2B4P23634 1241 aa13.29□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 TTC39AQ5SRH9 613 aa13.29□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 PI4K2BQ8TCG2 481 aa13.29□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 LEMD3Q9Y2U8 911 aa13.29□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa13.29□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 SCN9AQ15858 1988 aa13.28□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 YDJCA8MPS7 323 aa13.28□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 G3V3G9 751 aa13.28□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 RAD17O75943 681 aa13.28□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 GRIK5Q16478 980 aa13.28□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 CAVIN4Q5BKX8 364 aa13.28□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 DCAF8Q5TAQ9 597 aa13.28□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 TMC4Q7Z404 712 aa13.28□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 RTKN2Q8IZC4 609 aa13.28□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa13.28□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 ZAP70P43403 619 aa13.28□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 CD209Q9NNX6 404 aa13.28□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 ECHDC1Q9NTX5 307 aa13.28□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 ECE2O60344 883 aa13.27□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 CCDC158Q5M9N0 1113 aa13.27□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 HMG20BQ9P0W2 317 aa13.27□□□□□ -0.28
TTPA-201ENST00000260116 F8W031 263 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
TTPA-201ENST00000260116 GOLIM4O00461 696 aa13.27□□□□□ -0.29
TTPA-201ENST00000260116 GTF2IP78347 998 aa13.27□□□□□ -0.29
TTPA-201ENST00000260116 KIAA2012Q0VF49 1180 aa13.27□□□□□ -0.29
TTPA-201ENST00000260116 RILPL2Q969X0 211 aa13.27□□□□□ -0.29
TTPA-201ENST00000260116 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
TTPA-201ENST00000260116 GPR108Q9NPR9 543 aa13.27□□□□□ -0.29
TTPA-201ENST00000260116 ABCF2Q9UG63 623 aa13.27□□□□□ -0.29
TTPA-201ENST00000260116 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms