RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251775.8

SNX4-201, Transcript of sorting nexin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX4, Length 2,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4-201ENST00000251775 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 SPATA32Q96LK8 384 aa22.25■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 IL2RBP14784 551 aa22.24■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 ZNF165P49910 485 aa22.24■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.24■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.24■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.24■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 NR1I2O75469 434 aa22.23■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.23■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.23■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.23■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.23■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 ABCA3Q99758 1704 aa22.23■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 TIMM10P62072 90 aa22.22■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 KIF18AQ8NI77 898 aa22.22■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 LRRC24Q50LG9 513 aa22.22■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.22■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 PGBD1Q96JS3 809 aa22.22■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 SLFN14P0C7P3 912 aa22.21■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 CDC25BP30305 580 aa22.21■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 STK3Q13188 491 aa22.21■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 CEP135Q66GS9 1140 aa22.21■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 TNS2Q63HR2 1409 aa22.21■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 CYP21A2P08686 494 aa22.21■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 KRT32Q14532 448 aa22.21■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.21■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 NEK1Q96PY6 1258 aa22.21■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 STRN4Q9NRL3 753 aa22.21■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SNX4-201ENST00000251775 GPR108Q9NPR9 543 aa22.2■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 SLAIN2Q9P270 581 aa22.2■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.2■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 GOLIM4O00461 696 aa22.2■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 LAMA4Q16363 1823 aa22.19■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 EYA2O00167 538 aa22.19■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 LRRC8AQ8IWT6 810 aa22.19■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 PALLDQ8WX93 1383 aa22.19■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 USP27XA6NNY8 438 aa22.19■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 TAF3Q5VWG9 929 aa22.19■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 ZNF592Q92610 1267 aa22.19■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.19■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.19■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 ARID5BQ14865 1188 aa22.18■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 BICD2Q8TD16 824 aa22.18■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 IQCB1Q15051 598 aa22.17■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 SARM1Q6SZW1 724 aa22.17■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 Q6ZUG5 572 aa22.17■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.17■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.16■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 NYAP1Q6ZVC0 841 aa22.16■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.16■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 CAVIN2O95810 425 aa22.16■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 A0A1B0GUL7 405 aa22.15■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 EVA1CP58658 441 aa22.15■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 GTF3C6Q969F1 213 aa22.15■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 JAK2O60674 1132 aa22.15■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 CIAO1O76071 339 aa22.15■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 STRCQ7RTU9 1775 aa22.15■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa22.15■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.15■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 TERF2Q15554 542 aa22.14■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.14■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 ATG3Q9NT62 314 aa22.14■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
SNX4-201ENST00000251775 TCIRG1Q13488 830 aa22.14■■□□□ 1.13
SNX4-201ENST00000251775 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.14■■□□□ 1.13
SNX4-201ENST00000251775 KRT222Q8N1A0 295 aa22.14■■□□□ 1.13
SNX4-201ENST00000251775 FAM53CQ9NYF3 392 aa22.14■■□□□ 1.13
SNX4-201ENST00000251775 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.13■■□□□ 1.13
SNX4-201ENST00000251775 NEMFO60524 1076 aa22.13■■□□□ 1.13
SNX4-201ENST00000251775 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SNX4-201ENST00000251775 RESTQ13127 1097 aa22.13■■□□□ 1.13
SNX4-201ENST00000251775 PTPN14Q15678 1187 aa22.13■■□□□ 1.13
SNX4-201ENST00000251775 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.13■■□□□ 1.13
SNX4-201ENST00000251775 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SNX4-201ENST00000251775 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
SNX4-201ENST00000251775 V9GYY5 206 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SNX4-201ENST00000251775 A0A0G2JLW4 131 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX4-201ENST00000251775 SKILP12757 684 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX4-201ENST00000251775 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SNX4-201ENST00000251775 BRF1Q92994 677 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX4-201ENST00000251775 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX4-201ENST00000251775 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX4-201ENST00000251775 CCZ1BP86790 482 aa22.11■■□□□ 1.13
SNX4-201ENST00000251775 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SNX4-201ENST00000251775 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.11■■□□□ 1.13
SNX4-201ENST00000251775 SPEF2Q9C093 1822 aa22.11■■□□□ 1.13
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