RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 GRM8O00222 908 aa27.53■■■□□ 2
NME4-201ENST00000219479 ALDH1L1O75891 902 aa27.53■■■□□ 2
NME4-201ENST00000219479 NOGQ13253 232 aa27.53■■■□□ 2
NME4-201ENST00000219479 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
NME4-201ENST00000219479 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
NME4-201ENST00000219479 MINPP1Q9UNW1 487 aa27.53■■■□□ 2
NME4-201ENST00000219479 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa27.52■■■□□ 2
NME4-201ENST00000219479 ADM5C9JUS6 153 aa27.52■■■□□ 2
NME4-201ENST00000219479 CSF1RP07333 972 aa27.52■■■□□ 2
NME4-201ENST00000219479 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
NME4-201ENST00000219479 PTPRCP08575 1304 aa27.51■■□□□ 1.99
NME4-201ENST00000219479 SSH1Q8WYL5 1049 aa27.51■■□□□ 1.99
NME4-201ENST00000219479 MCOLN1Q9GZU1 580 aa27.51■■□□□ 1.99
NME4-201ENST00000219479 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
NME4-201ENST00000219479 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa27.5■■□□□ 1.99
NME4-201ENST00000219479 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
NME4-201ENST00000219479 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
NME4-201ENST00000219479 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
NME4-201ENST00000219479 VIL1P09327 827 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
NME4-201ENST00000219479 RGMBQ6NW40 437 aa27.49■■□□□ 1.99
NME4-201ENST00000219479 ANKRD2Q9GZV1 360 aa27.49■■□□□ 1.99
NME4-201ENST00000219479 CCT4P50991 539 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
NME4-201ENST00000219479 SMC4Q9NTJ3 1288 aa27.48■■□□□ 1.99
NME4-201ENST00000219479 MYH3P11055 1940 aa27.47■■□□□ 1.99
NME4-201ENST00000219479 KCNJ4P48050 445 aa27.47■■□□□ 1.99
NME4-201ENST00000219479 RGS19P49795 217 aa27.47■■□□□ 1.99
NME4-201ENST00000219479 FOXO4P98177 505 aa27.47■■□□□ 1.99
NME4-201ENST00000219479 ALDH1L2Q3SY69 923 aa27.47■■□□□ 1.99
NME4-201ENST00000219479 TAF7LQ5H9L4 462 aa27.47■■□□□ 1.99
NME4-201ENST00000219479 LMBR1LQ6UX01 489 aa27.47■■□□□ 1.99
NME4-201ENST00000219479 C2orf69Q8N8R5 385 aa27.47■■□□□ 1.99
NME4-201ENST00000219479 GGA3Q9NZ52 723 aa27.47■■□□□ 1.99
NME4-201ENST00000219479 ZNF609O15014 1411 aa27.47■■□□□ 1.99
NME4-201ENST00000219479 AKAP11Q9UKA4 1901 aa27.47■■□□□ 1.99
NME4-201ENST00000219479 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
NME4-201ENST00000219479 CCDC57Q2TAC2 916 aa27.46■■□□□ 1.99
NME4-201ENST00000219479 LEMD3Q9Y2U8 911 aa27.46■■□□□ 1.99
NME4-201ENST00000219479 SPEF2Q9C093 1822 aa27.46■■□□□ 1.99
NME4-201ENST00000219479 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 DGKZQ13574 1117 aa27.45■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 MED23Q9ULK4 1368 aa27.45■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 MIER1Q8N108 512 aa27.44■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 PODNQ7Z5L7 613 aa27.43■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 SULF1Q8IWU6 871 aa27.43■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 CCDC102AQ96A19 550 aa27.43■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 ZNF804BA4D1E1 1349 aa27.42■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 CHRNDQ07001 517 aa27.42■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 EPHA10Q5JZY3 1008 aa27.42■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 CDCA5Q96FF9 252 aa27.42■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 AGBL3Q8NEM8 1001 aa27.41■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 USP17L3A6NCW0 530 aa27.4■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 USP17L4A6NCW7 530 aa27.4■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 SLC10A3P09131 477 aa27.4■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 USP17L1Q7RTZ2 530 aa27.4■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 FBXW7Q969H0 707 aa27.4■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 SUCLG2Q96I99 432 aa27.4■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 COA1Q9GZY4 146 aa27.4■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 SAGE1Q9NXZ1 904 aa27.4■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa27.39■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 CNNM1Q9NRU3 951 aa27.39■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa27.39■■□□□ 1.98
NME4-201ENST00000219479 SCARF1Q14162 830 aa27.38■■□□□ 1.97
NME4-201ENST00000219479 GMLQ99445 158 aa27.38■■□□□ 1.97
NME4-201ENST00000219479 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
NME4-201ENST00000219479 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
NME4-201ENST00000219479 UTYO14607 1347 aa27.37■■□□□ 1.97
NME4-201ENST00000219479 TAF5LO75529 589 aa27.36■■□□□ 1.97
NME4-201ENST00000219479 RNF186Q9NXI6 227 aa27.36■■□□□ 1.97
NME4-201ENST00000219479 TXNRD3Q86VQ6 643 aa27.35■■□□□ 1.97
NME4-201ENST00000219479 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
NME4-201ENST00000219479 MYOZ2Q9NPC6 264 aa27.35■■□□□ 1.97
NME4-201ENST00000219479 PLIN1O60240 522 aa27.34■■□□□ 1.97
NME4-201ENST00000219479 TRPA1O75762 1119 aa27.34■■□□□ 1.97
NME4-201ENST00000219479 USP17L8P0C7I0 530 aa27.34■■□□□ 1.97
NME4-201ENST00000219479 KLRK1P26718 216 aa27.34■■□□□ 1.97
NME4-201ENST00000219479 CSRNP1Q96S65 589 aa27.34■■□□□ 1.97
NME4-201ENST00000219479 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
NME4-201ENST00000219479 SLC34A2O95436 690 aa27.33■■□□□ 1.97
NME4-201ENST00000219479 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.33■■□□□ 1.975e-8■□□□□ 9.6
NME4-201ENST00000219479 RASAL3Q86YV0 1011 aa27.33■■□□□ 1.97
NME4-201ENST00000219479 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
NME4-201ENST00000219479 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa27.33■■□□□ 1.97
NME4-201ENST00000219479 STRIP1Q5VSL9 837 aa27.32■■□□□ 1.96
NME4-201ENST00000219479 KAZALD1Q96I82 304 aa27.32■■□□□ 1.96
NME4-201ENST00000219479 OGFOD1Q8N543 542 aa27.31■■□□□ 1.96
NME4-201ENST00000219479 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
NME4-201ENST00000219479 MYO3BQ8WXR4 1341 aa27.31■■□□□ 1.96
NME4-201ENST00000219479 SNAP23O00161 211 aa27.3■■□□□ 1.96
NME4-201ENST00000219479 RARSP54136 660 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms