RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620466.4

ALMS1-208, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, human

TSL 2

Gene ALMS1, Length 6,720 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ALMS1-208	ENST00000620466	PNLIPRP2	P54317	469 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	KCNJ15	Q99712	375 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	IER2	Q9BTL4	223 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	NUDT9	Q9BW91	350 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	HES7	Q9BYE0	225 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	SIRPB1	O00241	398 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	FABP1	P07148	127 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	PI3	P19957	117 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	ST8SIA1	Q92185	356 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	C5orf49	A4QMS7	147 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466		F6UZH7	168 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	SH2D1B	O14796	132 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	ZNF626	Q68DY1	528 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	NUDT19	A8MXV4	375 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	NME2P1	O60361	137 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	CTAG2	O75638	210 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	GLA	P06280	429 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	GLB1	P16278	677 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	COL9A1	P20849	921 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	RTL8B	Q17RB0	113 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	SPIC	Q8N5J4	248 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	REEP6	Q96HR9	211 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	CTSF	Q9UBX1	484 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466		A0A1W2PPC4	97 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	OR5H15	A6NDH6	313 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	OR5H1	A6NKK0	313 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	HBE1	P02100	147 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	OR13C7	P0DN81	318 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	GABRA4	P48169	554 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	RAG2	P55895	527 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	TESK1	Q15569	626 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	C14orf79	Q96F83	325 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	PLK3	Q9H4B4	646 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	CTDSPL	O15194	276 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	LANCL1	O43813	399 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	CTRB1	P17538	263 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	FOXF1	Q12946	379 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	OR4C3	Q8NH37	302 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	MITD1	Q8WV92	249 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	TAAR5	O14804	337 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	OGG1	O15527	345 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	ZNF141	Q15928	474 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	ZNF425	Q6IV72	752 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	LGI3	Q8N145	548 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	KCNK15	Q9H427	330 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	GREM1	O60565	184 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	HNF1A	P20823	631 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ALMS1-208	ENST00000620466	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21

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