RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617087.1

PVT1-225, Transcript of Pvt1 oncogene, human

Gene PVT1, Length 130 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-225	ENST00000617087	NDUFA8	P51970	172 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	RAP1A	P62834	184 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	PAFAH1B2	P68402	229 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	SLC35B1	P78383	322 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	KIF14	Q15058	1648 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	VAMP3	Q15836	100 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	PID1	Q7Z2X4	250 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	ZNF786	Q8N393	782 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087		Q8N7P7	452 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	GPR26	Q8NDV2	337 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	TCEAL3	Q969E4	200 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	TREX1	Q9NSU2	369 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	NACA	E9PAV3	2078 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	KDM5C	P41229	1560 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	RAD1	O60671	282 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	TRAPPC6A	O75865	159 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	VAPB	O95292	243 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	THRA	P10827	490 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	ZNF823	P16415	610 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	CCNO	P22674	350 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	DTYMK	P23919	212 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	HTR2C	P28335	458 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	CD70	P32970	193 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	GPR4	P46093	362 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	MNAT1	P51948	309 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	OR10G6	Q8NH81	332 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	C12orf10	Q9HB07	376 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	STMN3	Q9NZ72	180 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087		A0A0U1RQV1	116 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	DFFA	O00273	331 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	GCG	P01275	180 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	APOA1	P02647	267 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	ARL2	P36404	184 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	GFER	P55789	205 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	TAS2R46	P59540	309 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	ESRRG	P62508	458 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	CPTP	Q5TA50	214 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	SNX20	Q7Z614	316 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	LINC01551	Q86U37	167 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	SYS1	Q8N2H4	156 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	OR2T29	Q8NH02	315 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	OR5W2	Q8NH69	310 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	PTX4	Q96A99	478 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	TEAD3	Q99594	435 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	HINT2	Q9BX68	163 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	HMG20A	Q9NP66	347 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	ZNF302	Q9NR11	478 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	TBX21	Q9UL17	535 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	PREX2	Q70Z35	1606 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	PTPRM	P28827	1452 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	TMEM94	Q12767	1356 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PVT1-225	ENST00000617087		E7EWF7	191 aa		3.54	□□□□□ -1.84

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