RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581080.1

RARA-AS1-201, RARA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARA-AS1, Length 1,790 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARA-AS1-201ENST00000581080 A0A075B6Q4 140 aa20.17■□□□□ 0.82
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RARA-AS1-201ENST00000581080 ACOT12Q8WYK0 555 aa20.12■□□□□ 0.81
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RARA-AS1-201ENST00000581080 XKRXQ6PP77 449 aa20.11■□□□□ 0.81
RARA-AS1-201ENST00000581080 TMEM108Q6UXF1 575 aa20.11■□□□□ 0.81
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RARA-AS1-201ENST00000581080 PEX16Q9Y5Y5 336 aa20.11■□□□□ 0.81
RARA-AS1-201ENST00000581080 CD300LBA8K4G0 201 aa20.11■□□□□ 0.81
RARA-AS1-201ENST00000581080 GMDSO60547 372 aa20.11■□□□□ 0.81
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