RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 PTGER4P35408 488 aa25.31■■□□□ 1.64
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CTDNEP1-208ENST00000573600 GSG1Q2KHT4 349 aa25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 TBRG1Q3YBR2 411 aa25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 NOX3Q9HBY0 568 aa25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 FBLN5Q9UBX5 448 aa25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 CIB4A0PJX0 185 aa25.3■■□□□ 1.64
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CTDNEP1-208ENST00000573600 HIKESHIQ53FT3 197 aa25.3■■□□□ 1.64
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CTDNEP1-208ENST00000573600 AWAT2Q6E213 333 aa25.3■■□□□ 1.64
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SPSB4Q96A44 273 aa25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 DOCK7Q96N67 2140 aa25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 CACNG2Q9Y698 323 aa25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 CENPXA8MT69 81 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 KRT74Q7RTS7 529 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 DUSP18Q8NEJ0 188 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 EXTL1Q92935 676 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 ITPKCQ96DU7 683 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 NEK6Q9HC98 313 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 URB1O60287 2271 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
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CTDNEP1-208ENST00000573600 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa25.29■■□□□ 1.64
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CTDNEP1-208ENST00000573600 UBE2V2Q15819 145 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 CADM3Q8N126 398 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPER1Q99527 375 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 AUNIPQ9H7T9 357 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 C5orf49A4QMS7 147 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 METTL21EPA6NDL7 271 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 ECDO95905 644 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 UBBP0CG47 229 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 EDN3P14138 238 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 ACKR3P25106 362 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 GDNFP39905 211 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM3AP98173 230 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPR176Q14439 515 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR52I2Q8NH67 350 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 ITFG2Q969R8 447 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 POM121L2Q96KW2 1035 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 LUZP4Q9P127 313 aa25.28■■□□□ 1.64
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CTDNEP1-208ENST00000573600 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCNOP22674 350 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 APLNRP35414 380 aa25.27■■□□□ 1.64
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF92Q03936 586 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 PMPCAQ10713 525 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 DYRK1AQ13627 763 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR8B8Q15620 311 aa25.27■■□□□ 1.64
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CTDNEP1-208ENST00000573600 DNM1P46Q6ZS02 220 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR2W3Q7Z3T1 314 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 BIVMQ86UB2 503 aa25.27■■□□□ 1.64
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CTDNEP1-208ENST00000573600 AP3S2P59780 193 aa25.26■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-208ENST00000573600 VWA1Q6PCB0 445 aa25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPSB1Q96BD6 273 aa25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 SCGNO76038 276 aa25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 TPOP07202 933 aa25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 GSTT2BP0CG30 244 aa25.26■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-208ENST00000573600 VSIG8P0DPA2 414 aa25.26■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PLET1Q6UQ28 207 aa25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF584Q8IVC4 421 aa25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 BOD1Q96IK1 185 aa25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 GHRLQ9UBU3 117 aa25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM14DPA8MWL7 114 aa25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 KDM4BO94953 1096 aa25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
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