RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 FCRL1Q96LA6 429 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 NODALQ96S42 347 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 TIMP4Q99727 224 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 TBL1YQ9BQ87 522 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 AMBNQ9NP70 447 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 IL23AQ9NPF7 189 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 AKIP1Q9NQ31 210 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 RLIMQ9NVW2 624 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 SBF1O95248 1867 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 KAT6AQ92794 2004 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 MYLKQ15746 1914 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 COL1A2P08123 1366 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 A0A1B0GTL3 188 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 A0A1W2PR48 441 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 SLC22A20A6NK97 555 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 PLPP3O14495 311 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 FFAR3O14843 346 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 SOX15O60248 233 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 ENTPD6O75354 484 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 GABARAPO95166 117 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 HIST1H2ABP04908 130 aa4.84□□□□□ -1.63
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CAPN3-211ENST00000562199 GIPP09681 153 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF17P17021 662 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 TBPP20226 339 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 HIST1H2ADP20671 130 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 SLC2A5P22732 501 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 HTR1EP28566 365 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 IL12AP29459 219 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 OPRL1P41146 370 aa4.84□□□□□ -1.63
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CAPN3-211ENST00000562199 RAB25P57735 213 aa4.84□□□□□ -1.63
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CAPN3-211ENST00000562199 ROM1Q03395 351 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 PLA2G7Q13093 441 aa4.84□□□□□ -1.63
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CAPN3-211ENST00000562199 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
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CAPN3-211ENST00000562199 ZNF613Q6PF04 617 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 LANCL3Q6ZV70 420 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 DOLPP1Q86YN1 238 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 SLC30A8Q8IWU4 369 aa4.84□□□□□ -1.63
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CAPN3-211ENST00000562199 OR9I1Q8NGQ6 314 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 OR6K2Q8NGY2 324 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 OR56B4Q8NH76 319 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 OR5K1Q8NHB7 308 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 C16orf52Q8NHV5 167 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 SYNPRQ8TBG9 265 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 RNF138Q8WVD3 245 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 DEDD2Q8WXF8 326 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 ASB10Q8WXI3 467 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 DNASE2BQ8WZ79 361 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 LRRC58Q96CX6 371 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 SMARCD1Q96GM5 515 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 ST6GAL2Q96JF0 529 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 KCTD7Q96MP8 289 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 OR7D2Q96RA2 312 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 FCRL5Q96RD9 977 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 FUNDC2Q9BWH2 189 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 SUCNR1Q9BXA5 334 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 RNF122Q9H9V4 155 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 SLC6A20Q9NP91 592 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 PLSCR3Q9NRY6 295 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 TMEM45AQ9NWC5 275 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 NLKQ9UBE8 527 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 STEAP1Q9UHE8 339 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 FIS1Q9Y3D6 152 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CAPN3-211ENST00000562199 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CAPN3-211ENST00000562199 MEIKINA0A087WXM9 373 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPN3-211ENST00000562199 C1orf226A1L170 272 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPN3-211ENST00000562199 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CAPN3-211ENST00000562199 NKX2-6A6NCS4 301 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPN3-211ENST00000562199 TVP23AA6NH52 213 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPN3-211ENST00000562199 CLDN24A6NM45 220 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPN3-211ENST00000562199 A8MXK9 166 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPN3-211ENST00000562199 C1orf196B1AJZ1 125 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPN3-211ENST00000562199 C17orf105B2RV13 164 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPN3-211ENST00000562199 GFYI3L273 518 aa4.83□□□□□ -1.64
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