RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		2.17	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	VSIG4	Q9Y279	399 aa		2.17	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	2.17	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957		V9GYQ6	96 aa		2.17	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		2.17	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	MSH6	P52701	1360 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A0G2JLM5	398 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A0G2JRQ6	117 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A0J9YWU9	116 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	PHYH	O14832	338 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	UBD	O15205	165 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	BIRC5	O15392	142 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	FABP7	O15540	132 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	TGOLN2	O43493	480 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	SSNA1	O43805	119 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	MPZL2	O60487	215 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	DPM1	O60762	260 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	CTNS	O60931	367 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	UPK1B	O75841	260 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	SNAP29	O95721	258 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	SEMA4F	O95754	770 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	CLDN1	O95832	211 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	C6orf47	O95873	294 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	RLN2	P04090	185 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	OR4E1	P0C645	316 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	PGA4	P0DJD7	388 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	PGA3	P0DJD8	388 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	PGA5	P0DJD9	388 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	THRA	P10827	490 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	GABRG2	P18507	467 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	F2R	P25116	425 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	LMO2	P25791	158 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	AQP5	P55064	265 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	DLX6	P56179	175 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB38	P57729	211 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	OR12D2	P58182	307 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP1CB	P62140	327 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	MXD1	Q05195	221 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	SMARCB1	Q12824	385 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	CDC20	Q12834	499 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	PDK2	Q15119	407 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	TRAM1	Q15629	374 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	ALX1	Q15699	326 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	GUK1	Q16774	197 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	TMUB2	Q71RG4	321 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	CDC20B	Q86Y33	519 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	C6orf223	Q8N319	242 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM222B	Q8WU58	562 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	APH1B	Q8WW43	257 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	NELFB	Q8WX92	580 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	FGGY	Q96C11	551 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC42	Q96M95	316 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF488	Q96MN9	340 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	KCTD7	Q96MP8	289 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF145	Q96MT1	663 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	P2RX4	Q99571	388 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	ATF6B	Q99941	703 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	SYT15	Q9BQS2	421 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	COA1	Q9GZY4	146 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	ARL6	Q9H0F7	186 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBP1	Q9H171	429 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	ABCB9	Q9NP78	766 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	MED4	Q9NPJ6	270 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		2.15	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		2.15	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	AGRN	O00468	2067 aa		2.15	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		2.15	□□□□□ -2.07

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