RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 H0YAE9 185 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 SOCS2O14508 198 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 CDC42EP2O14613 210 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 ACOT8O14734 319 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 ANGPTL7O43827 346 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 IFNW1P05000 195 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 DUX4L2P0CJ85 424 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 DUX4L3P0CJ86 424 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 DUX4L4P0CJ87 422 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 DUX4L5P0CJ88 424 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 DUX4L6P0CJ89 424 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 DUX4L7P0CJ90 424 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 POU1F1P28069 291 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 GPR4P46093 362 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 DLX1P56177 255 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 SELENOWP63302 87 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 ZNF92Q03936 586 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 DOC2BQ14184 412 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 RFX4Q33E94 735 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 CYBRD1Q53TN4 286 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 SLC18B1Q6NT16 456 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 CFAP77Q6ZQR2 320 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 OR8J3Q8NGG0 315 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 OR4C15Q8NGM1 316 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 RORBQ92753 470 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 PRSS22Q9GZN4 317 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 DUX4Q9UBX2 424 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 KCNG2Q9UJ96 466 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 CAPN7Q9Y6W3 813 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 A0A087WUU8 490 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 A0A1W2PPH5 198 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 XRCC2O43543 280 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 CHST1O43916 411 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 TXNDC12O95881 172 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 RENP00797 406 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 BMXP51813 675 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 LGALS4P56470 323 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 CAV3P56539 151 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 STUMQ69YW2 141 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 NANOGP8Q6NSW7 305 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 DRAM2Q6UX65 266 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 WDR82Q6UXN9 313 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 PTCHD4Q6ZW05 846 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 CPLX4Q7Z7G2 160 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 NAA40Q86UY6 237 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 LINC00346Q8IVM7 164 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 SLC26A10Q8NG04 563 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 OR1M1Q8NGA1 313 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 OR56B2PQ8NGI1 322 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 OR2AE1Q8NHA4 323 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 DDOQ99489 341 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 WNT10AQ9GZT5 417 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 ANKRD19PQ9H560 264 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 B9D1Q9UPM9 204 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 F2RL2O00254 374 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 HLA-DQA2P01906 255 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP9.66□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 NDUFB7P17568 137 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 KDELR2P33947 212 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 YAP1P46937 504 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 SLC7A2P52569 658 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 SPIBQ01892 262 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 SNCBQ16143 134 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 SNAI3Q3KNW1 292 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 GLYATL3Q5SZD4 288 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 ZNF788Q6ZQV5 615 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 CYP4Z1Q86W10 505 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 LNX2Q8N448 690 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 CYB561A3Q8NBI2 242 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 OR10Z1Q8NGY1 313 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 C17orf50Q8WW18 174 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 STON2Q8WXE9 905 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 TSSK2Q96PF2 358 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 ABCB10Q9NRK6 738 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 HAO2Q9NYQ3 351 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 RHCGQ9UBD6 479 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 SIGLEC7Q9Y286 467 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-228ENST00000551473 A0A1W2PPE2 198 aa9.65□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms