RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498399.1

TIMMDC1-209, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TIMMDC1, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-209ENST00000498399 CAV3P56539 151 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 CTBP2P56545 445 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 WNT4P56705 351 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR1D5P58170 312 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 STARD6P59095 220 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 TAS2R41P59536 307 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 CTAG1AP78358 180 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 TNFRSF17Q02223 184 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP3.48□□□□□ -1.859e-7■■□□□ 12.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 C1DQ13901 141 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 GANABQ14697 944 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 DUSP5Q16690 384 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 DEFB133Q30KQ1 61 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 HLA-BQ31612 363 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 HACD4Q5VWC8 232 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 CASP12Q6UXS9 341 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMEM64Q6YI46 380 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMEM91Q6ZNR0 172 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 COX8CQ7Z4L0 72 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 COMMD7Q86VX2 200 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR4N5Q8IXE1 308 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 UBALD2Q8IYN6 164 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 ARL14Q8N4G2 192 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 LINC00471Q8N535 108 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 LRRC17Q8N6Y2 441 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 SYT14Q8NB59 555 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 GPR32P1Q8NGA4 272 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR11H7Q8NGC8 314 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR5T2Q8NGG2 359 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR4D11Q8NGI4 311 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR5D16Q8NGK9 328 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR9A2Q8NGT5 310 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR2T6Q8NHC8 308 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 SFXN5Q8TD22 340 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 ACOT12Q8WYK0 555 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 UFD1Q92890 307 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 HGDQ93099 445 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMEM203Q969S6 136 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 TGM7Q96PF1 710 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR2M2Q96R28 347 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR2A5Q96R48 311 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF649Q9BS31 505 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 REG4Q9BYZ8 158 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 MED28Q9H204 178 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 PIGUQ9H490 435 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 C5orf66Q9H5L9 145 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 LYRM4Q9HD34 91 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 C12orf4Q9NQ89 552 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 STARD5Q9NSY2 213 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 TVP23BQ9NYZ1 205 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 COMMD3Q9UBI1 195 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 POMT2Q9UKY4 750 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 MGAT4AQ9UM21 535 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 PLCL2Q9UPR0 1127 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC22A7Q9Y694 548 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 BPTFQ12830 3046 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 TRPM6Q9BX84 2022 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 UNC80Q8N2C7 3258 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 MEIKINA0A087WXM9 373 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 A0A087WZ39 114 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 A0A1B0GVI7 797 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 A0A1W2PRV1 198 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 CIB4A0PJX0 185 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 SMIM30A4D0T7 59 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF860A6NHJ4 632 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 I3L1I5 382 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 I3L521 148 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 HMGN4O00479 90 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 GABRPO00591 440 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 CASKO14936 926 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 CASC3O15234 703 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 LRRTM2O43300 516 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 CHST10O43529 356 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 NDUFA2O43678 99 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 LANCL1O43813 399 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 B4GALT2O60909 372 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 TSC22D2O75157 780 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 SAP30O75446 220 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 STX11O75558 287 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 GOSR1O95249 250 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 SOX14O95416 240 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 PAHP00439 452 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 LALBAP00709 142 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 CFDP00746 253 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 IFNA7P01567 189 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 IGHEP01854 428 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 DCNP07585 359 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 SBK2P0C263 348 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 RNF224P0DH78 156 aa3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms