RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 TMEM156Q8N614 296 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 CLRN3Q8NCR9 226 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 OR5D14Q8NGL3 314 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 NICN1Q9BSH3 213 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 SELENOIQ9C0D9 397 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 RAB22AQ9UL26 194 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 DOCK10Q96BY6 2186 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 A0A0G2JMM0 328 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 A0A1W2PPB8 328 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 A0A1W2PRS3 328 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 C19orf67A6NJJ6 358 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 HMSDA8MTL9 139 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 KIR3DP1A8MWS1 328 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 KRBOX1C9JBD0 128 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 SULT1C2O00338 296 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 CYB5AP00167 134 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 PPP3CBP16298 524 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 ZNF20P17024 532 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 OR5AS1Q8N127 324 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 SLC22A24Q8N4F4 322 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 ZNF283Q8N7M2 679 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 TMEM104Q8NE00 496 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 SCARB1Q8WTV0 552 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 AQP3Q92482 292 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 MFFQ9GZY8 342 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 SCPEP1Q9HB40 452 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 SLC39A1Q9NY26 324 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 A0A1W2PP11 408 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 OR6C65A6NJZ3 312 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 C9J4A7 227 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 LIFP15018 202 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 ADH6P28332 368 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 SSR4P51571 173 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 MC2RQ01718 297 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 AWAT2Q6E213 333 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 TCEAL6Q6IPX3 200 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 LRRC18Q8N456 261 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 OR13C8Q8NGS7 320 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 OR2Y1Q8NGV0 311 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 TCEAL3Q969E4 200 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 ZBTB8AQ96BR9 441 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 ZNF75AQ96N20 296 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 ANGPTL4Q9BY76 406 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 WDR13Q9H1Z4 485 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 PISDQ9UG56 409 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 ATPIF1Q9UII2 106 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-213ENST00000492657 TMEM82A0PJX8 343 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 OR5H15A6NDH6 313 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 METTL21EPA6NDL7 271 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 OR3A4PP47883 348 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 H3F3AP84243 136 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 BAMBIQ13145 260 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 ZNF529Q6P280 563 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 PDZD9Q8IXQ8 264 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 ZNF101Q8IZC7 436 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 OR10K1Q8NGX5 313 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 BANF2Q9H503 90 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 TAS2R3Q9NYW6 316 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 NCKAP5O14513 1909 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 A0A0A6YYD4 124 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 A0A0J9YW62 118 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 B3GALNT1O75752 331 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 OR4E1P0C645 316 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 EXT1Q16394 746 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 ZNF584Q8IVC4 421 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 BPIFCQ8NFQ6 507 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 NPRL2Q8WTW4 380 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 DKKL1Q9UK85 242 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 F5H5K5 113 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 TNFSF11O14788 317 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 RAB6AP20340 208 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 CBX5P45973 191 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 CSNK1A1P48729 337 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 PTX4Q96A99 478 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 MPIG6BO95866 241 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 F10P00742 488 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 CD74P04233 296 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 OTX2P32243 289 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 CXADRP78310 365 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 PDSS1Q5T2R2 415 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 M1APQ8TC57 530 aa11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms