RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484581.6

VPS13A-211, Transcript of vacuolar protein sorting 13 homolog A, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A, Length 1,155 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-211ENST00000484581 ASTN1O14525 1302 aa3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 CA11O75493 328 aa3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 RP2O75695 350 aa3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 BCHEP06276 602 aa3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 ADRB3P13945 408 aa3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 SSTR5P35346 364 aa3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 TAS2R46P59540 309 aa3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 SLC35A1P78382 337 aa3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 LTBP1Q14766 1721 aa3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 ZNF79Q15937 498 aa3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 TCEAL5Q5H9L2 206 aa3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 FAM27D1Q5T7N8 215 aa3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 CROCCQ5TZA2 2017 aa3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 NKAIN4Q8IVV8 208 aa3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 Q8N9W7 124 aa3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 GPR26Q8NDV2 337 aa3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 C19orf18Q8NEA5 215 aa3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 MNS1Q8NEH6 495 aa3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 OR10G6Q8NH81 332 aa3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 ZFAND1Q8TCF1 268 aa3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 DOK4Q8TEW6 326 aa3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 TCEAL3Q969E4 200 aa3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 TM4SF18Q96CE8 201 aa3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 CYTH2Q99418 400 aa3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 GABRG3Q99928 467 aa3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 TIMM29Q9BSF4 260 aa3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 COPS4Q9BT78 406 aa3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 MED10Q9BTT4 135 aa3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 PLEKHA1Q9HB21 404 aa3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 TMEM27Q9HBJ8 222 aa3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 RHBDL2Q9NX52 303 aa3.06□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 TRPC5OSA6NMA1 111 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 TRIM49D1C9J1S8 452 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 H0Y9J4 135 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 PLPP3O14495 311 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 ZNF861PO60384 105 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 SLC35G6P0C7Q6 338 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 PRPS2P11908 318 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 ELK1P19419 428 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 TCN2P20062 427 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 CD70P32970 193 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 GGT2P36268 569 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 RGS6P49758 472 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 LHX2P50458 406 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 CDKN2DP55273 166 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 TSPAN5P62079 268 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 RNF212Q495C1 297 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 TFDP3Q5H9I0 405 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 STEAP4Q687X5 459 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 RTL4Q6ZR62 310 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 FAM92BQ6ZTR7 304 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 CD302Q8IX05 232 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 PIFOQ8TCI5 191 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 ADTRPQ96IZ2 230 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 CEP170P1Q96L14 293 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 ZNF75AQ96N20 296 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 SERPINB11Q96P15 392 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 SULT4A1Q9BR01 284 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 BBS2Q9BXC9 721 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 SLC40A1Q9NP59 571 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 MS4A12Q9NXJ0 267 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 MAT2BQ9NZL9 334 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 AP3M1Q9Y2T2 418 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 HES2Q9Y543 173 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 LRP4O75096 1905 aa3.05□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 NOTCH2Q04721 2471 aa3.04□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa3.04□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.04□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa3.04□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa3.04□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 A0A1B0GUA9 196 aa3.04□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 hCG_2039718K7EN88 272 aa3.04□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 SNAI2O43623 268 aa3.04□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 CALUO43852 315 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 SCN2BO60939 215 aa3.04□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 CDK14O94921 469 aa3.04□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 PTTG1O95997 202 aa3.04□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 P01737 135 aa3.04□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 LIPCP11150 499 aa3.04□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 PCK1P35558 622 aa3.04□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 TALDO1P37837 337 aa3.04□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 P2RY2P41231 377 aa3.04□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 GALR1P47211 349 aa3.04□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 OR2B6P58173 313 aa3.04□□□□□ -1.92
VPS13A-211ENST00000484581 DSTNP60981 165 aa3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms