RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 Q499Y3 187 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CTXN3Q4LDR2 81 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 FAM27D1Q5T7N8 215 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CYB5R2Q6BCY4 276 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 DEGS2Q6QHC5 323 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 Q6ZRG5 221 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SERPINA9Q86WD7 417 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 GKN2Q86XP6 184 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CACUL1Q86Y37 369 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TTC9BQ8N6N2 239 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TMEM99Q8N816 258 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 COX18Q8N8Q8 333 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SUMF2Q8NBJ7 301 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 C17orf47Q8NEP4 570 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 OR10H4Q8NGA5 316 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 OR1P1Q8NH06 330 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 OR51A7Q8NH64 312 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ZNF480Q8WV37 535 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 OIT3Q8WWZ8 545 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 DNASE2BQ8WZ79 361 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 EXTL1Q92935 676 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TMEM159Q96B96 161 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 GPA33Q99795 319 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SYT3Q9BQG1 590 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 EBPLQ9BY08 206 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 NELFAQ9H3P2 528 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 IL21RQ9HBE5 538 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ADGRL4Q9HBW9 690 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 G6PC2Q9NQR9 355 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 LANCL2Q9NS86 450 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TMEM140Q9NV12 185 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ANKRD10Q9NXR5 420 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 HSPB7Q9UBY9 170 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ICAM5Q9UMF0 924 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 YIPF1Q9Y548 306 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 BRWD1Q9NSI6 2320 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 A0A087WWL8 130 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 A0A1W2PPE2 198 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CPED1A4D0V7 1026 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ANTXRLA6NF34 631 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 C9JQL5 133 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 PROB1E7EW31 1015 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SOCS6O14544 535 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 GRM6O15303 877 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 LRP3O75074 770 aa6.38□□□□□ -1.39
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PKP4-211ENST00000481115 TNFSF13O75888 250 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SLC16A8O95907 504 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 C1QCP02747 245 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 AMBPP02760 352 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CD3DP04234 171 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 UMODP07911 640 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CT45A8P0DMV1 189 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CT45A9P0DMV2 189 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TAS2R41P59536 307 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 PFN3P60673 137 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 IL15RAQ13261 267 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 GPM6BQ13491 265 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 MORN2Q502X0 79 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ZNF385BQ569K4 471 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 GPR157Q5UAW9 335 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 STAC2Q6ZMT1 411 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 MED25Q71SY5 747 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TCF24Q7RTU0 167 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TMEM150AQ86TG1 271 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 LINC01551Q86U37 167 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 NUP43Q8NFH3 380 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 OR8U1Q8NH10 309 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 OR2V1Q8NHB1 315 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 NPRL2Q8WTW4 380 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 Q8WTZ3 238 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SPSB4Q96A44 273 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 PELI1Q96FA3 418 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 PCED1BQ96HM7 432 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SLC41A2Q96JW4 573 aa6.38□□□□□ -1.39
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