RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 OR9Q2Q8NGE9 314 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 OR8D4Q8NGM9 314 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 SPTSSAQ969W0 71 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 COPS4Q9BT78 406 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 CNTD2Q9H8S5 307 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 VIPAS39Q9H9C1 493 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 SNTG1Q9NSN8 517 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 AP3M1Q9Y2T2 418 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 FAM96BQ9Y3D0 163 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 TBX1O43435 398 aa9.2□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 SEMG1P04279 462 aa9.2□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 LIPFP07098 398 aa9.2□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 ZNF823P16415 610 aa9.2□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 RRM2P31350 389 aa9.2□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 GSSP48637 474 aa9.2□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 BPIFB3P59826 476 aa9.2□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 KCNJ8Q15842 424 aa9.2□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 GFOD2Q3B7J2 385 aa9.2□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 CDONQ4KMG0 1287 aa9.2□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 PGBD2Q6P3X8 592 aa9.2□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 LYG1Q8N1E2 194 aa9.2□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 Q8N7P7 452 aa9.2□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 PPP1R35Q8TAP8 253 aa9.2□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 SLAMF6Q96DU3 332 aa9.2□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 DDOQ99489 341 aa9.2□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 WDR13Q9H1Z4 485 aa9.2□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 TOR3AQ9H497 397 aa9.2□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 EFCAB1Q9HAE3 211 aa9.2□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 BRD7Q9NPI1 651 aa9.2□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa9.2□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 ABCD2Q9UBJ2 740 aa9.2□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa9.2□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 BHLHE40O14503 412 aa9.19□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 SLC22A2O15244 555 aa9.19□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 CRMP1Q14194 572 aa9.19□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 TAF13Q15543 124 aa9.19□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 KLHL12Q53G59 568 aa9.19□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 TEX36Q5VZQ5 186 aa9.19□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 WDR82Q6UXN9 313 aa9.19□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 SLC16A9Q7RTY1 509 aa9.19□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 DPY19L4Q7Z388 723 aa9.19□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 SLC37A3Q8NCC5 494 aa9.19□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 LY6G5BQ8NDX9 201 aa9.19□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 OR8S1Q8NH09 359 aa9.19□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 RORBQ92753 470 aa9.19□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 SGK3Q96BR1 496 aa9.19□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 ITPKCQ96DU7 683 aa9.19□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 PYURFQ96I23 114 aa9.19□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 AMELYQ99218 206 aa9.19□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 PPA2Q9H2U2 334 aa9.19□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 MED20Q9H944 212 aa9.19□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 MRGBPQ9NV56 204 aa9.19□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 TAS2R1Q9NYW7 299 aa9.19□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 ZNRD1Q9P1U0 126 aa9.19□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 ZNF319Q9P2F9 582 aa9.19□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 FOXJ3Q9UPW0 622 aa9.19□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa9.19□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 DHRS12A0PJE2 317 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 CDIPTO14735 213 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 NPFFO15130 113 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 SOX14O95416 240 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 SAA4P35542 130 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 CX3CR1P49238 355 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 FAM3AP98173 230 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 LY6EQ16553 131 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 DMRTC1Q5HYR2 192 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 SLC35E4Q6ICL7 350 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 DRAM2Q6UX65 266 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 HACD2Q6Y1H2 254 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 FAM57BQ71RH2 274 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 OR1M1Q8NGA1 313 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 OR4Q3Q8NH05 313 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 BTBD10Q9BSF8 475 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 SLC22A4Q9H015 551 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 DPAGT1Q9H3H5 408 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 C16orf95Q9H693 158 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 ZNF446Q9NWS9 450 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 KCNG2Q9UJ96 466 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 ZNF391Q9UJN7 358 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 VPREB3Q9UKI3 123 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 KPTNQ9Y664 436 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 CDH10Q9Y6N8 788 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
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